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An empirical study on cross-phase code modification behaviors in incremental programming projects 认领 引用
1
作者 Jing Jiang Chenhong Ji +1 位作者 Li Zhang Haiyan Yang 《计算机教育》 2026年第6期280-291,共12页
This paper conducts an empirical study on students'code modification behaviors in incremental programming projects by analyzing 40771 code submissions from 371 students through abstract syntax tree(AST)difference ... This paper conducts an empirical study on students'code modification behaviors in incremental programming projects by analyzing 40771 code submissions from 371 students through abstract syntax tree(AST)difference analysis and manual annotation.The study investigates the distribution of code modification types to prior-phase code during iterative development,identifies cross-phase error types,and analyzes refactoring strategies.The findings reveal that error correction and code refactoring constitute the primary types of cross-phase code modifications.Among cross-phase latent errors,special case neglect represents the dominant error type,indicating insufficient coverage of special scenarios in existing test suites.Variable renaming emerges as the most prevalent refactoring behavior,reflecting students'emphasis on code readability.These research findings provide empirical evidence for optimizing incremental curriculum design,improving test cases,and cultivating students'code maintenance capabilities in programming education. 展开更多
关键词 Incremental projects Code modification Error correction Code refactoring Computer science education
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Site-specific protein modification by genetic encoded disulfide compatible thiols 认领 引用
2
作者 Xinyu Ling Heqi Chen +3 位作者 Wei Zheng Liying Chang Yong Wang Tao Liu 《Chinese Chemical Letters》 SCIE CAS CSCD 2020年第1期163-166,共4页
Cysteine chemistry provides a low cost and convenient way for site-specific protein modification.However,recombinant expression of disulfide bonding containing protein with unpaired cysteine is technically challenging... Cysteine chemistry provides a low cost and convenient way for site-specific protein modification.However,recombinant expression of disulfide bonding containing protein with unpaired cysteine is technically challenging and the resulting protein often suffers from significantly reduced yield and activity.Here we used genetic code expansion technique to introduce a surface exposed self-paired dithiol functional group into proteins,which can be selectively reduced to afford active thiols.Two compounds containing self-paired disulfides were synthesized,and their genetic incorporations were validated using green fluorescent proteins(GFP).The compatibility of these self-paired di-thiols with natural disulfide bond was demonstrated using antibody fragment to afford site-specifically labeled antibody.This work provides another valuable building block into the chemical tool-box for site-specific labeling of proteins containing internal disulfides. 展开更多
关键词 Cysteine chemistry Genetic code expansion Protein modification Biorthogonal chemistry Disulfide bond
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Histone modifications dictate specific biological readouts 认领 引用 被引量：13
3
作者 Anjana Munshi Gowhar Shafi +1 位作者 Nishat Aliya Akka Jyothy 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS 2009年第2期75-88,共14页
The basic unit of chromatin is the nucleosomal core particle, containing 147 bp of DNA that wraps twice around an octamer of core histones. The core histones bear a highly dynamic N-terminal amino acid tail around 20-... The basic unit of chromatin is the nucleosomal core particle, containing 147 bp of DNA that wraps twice around an octamer of core histones. The core histones bear a highly dynamic N-terminal amino acid tail around 20-35 residues in length and rich in basic amino acids. These tails extending from the surface of nucleosome play an important role in folding of nucleosomal arrays into higher order chromatin structure, which plays an important role in eukaryotic gene regulation. The amino terminal tails protruding from the nuclesomes get modified by the addition of small groups such as methyl, acetyl and phosphoryl groups. In this review, we focus on these complex modi- fication patterns and their biological functions. Moreover, these modifications seem to be part of a complex scheme where distinct histone modifications act in a sequential manner or in combination to form a ＂histone code＂ read by other proteins to control the structure and/or function of the chromatin fiber. Errors in this histone code may be involved in many human diseases especially cancer, the nature of which could be therapeutically exploited. Increasing evidence suggests that many proteins bear multiple, distinct modifications, and the ability of one modification to antagonize or synergize the deposition of another can have significant biological consequences. 展开更多
关键词 histone modifications gene expression and silencing heterochromatin therapeutic exploitation histone code
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电离辐射对表观遗传修饰影响的研究进展 认领 引用
4
作者 汤明威 张丹丹 +3 位作者 孙培琳 斯琴图雅 张子呈 滕卫丽 《辐射研究与辐射工艺学报》 CAS CSCD 2026年第3期1-14,共14页
电离辐射作为一种重要的胁迫手段,能够对生物体造成损伤,其对生物体造成DNA损伤的机制已得到较为明确的解析。随着研究深入,电离辐射的生物效应研究已从经典的DNA损伤与修复机制,逐步拓展至表观遗传学这一新兴前沿领域。本文系统地综述... 电离辐射作为一种重要的胁迫手段,能够对生物体造成损伤,其对生物体造成DNA损伤的机制已得到较为明确的解析。随着研究深入,电离辐射的生物效应研究已从经典的DNA损伤与修复机制,逐步拓展至表观遗传学这一新兴前沿领域。本文系统地综述了电离辐射对植物表观遗传修饰影响的研究进展,重点探讨了DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA及RNA甲基化等表观遗传机制在辐射胁迫下的动态变化及其生物学意义。为理解辐射表观遗传效应提供了理论基础,并对辐射防护、癌症治疗与作物育种等领域具有重要参考价值。 展开更多
关键词 电离辐射 表观遗传修饰 DNA甲基化 组蛋白修饰 非编码RNA
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基于表观遗传学探讨类风湿关节炎的发病机制与中药治疗 认领 引用
5
作者 肖妮沁 武子琛 +4 位作者 晏和国 曾三金 陈冰冰 谢招虎 李兆福 《生命的化学》 CAS 2026年第7期1285-1295,共11页
类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是一种以慢性、对称性多关节滑膜炎为主要特征的自身免疫性疾病,可进展为关节炎性浸润、骨组织破坏、关节畸形甚至终身残疾。RA的发病机制十分复杂,目前尚无根治手段。有学者提出,RA的发病机制与... 类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是一种以慢性、对称性多关节滑膜炎为主要特征的自身免疫性疾病,可进展为关节炎性浸润、骨组织破坏、关节畸形甚至终身残疾。RA的发病机制十分复杂,目前尚无根治手段。有学者提出,RA的发病机制与表观遗传、环境因素及免疫系统之间的多重相互作用有关。表观遗传紊乱可在不改变DNA序列的条件下可逆调控基因表达,是介导RA免疫失衡、滑膜异常活化及骨组织损伤的重要分子机制。现有研究表明,表观遗传主要涉及DNA甲基化异常、组蛋白多重修饰及非编码RNA调控紊乱,三者共同参与RA的发生及发展。中医药可通过靶向纠正多种表观遗传异常,抑制炎症级联反应、改善关节损伤,为RA的有效防治提供了新型研究方向。本文系统归纳了各类表观遗传模式在RA中的调控与交互作用,阐述了如何区分表观遗传异常的驱动效应与伴随现象,梳理了中药单体及复方靶向表观遗传调控的研究进展,分析了当前研究的局限与临床转化瓶颈,以期为中医药治疗RA的现代研究提供新思路、新视角。 展开更多
关键词 类风湿关节炎 表观遗传 DNA甲基化 组蛋白修饰 非编码RNA 中医药
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工程化外泌体长链非编码RNA在骨质疏松治疗中的创新策略 认领 引用
6
作者 张传林 吴玉怀 +4 位作者 周海祥 刘建平 徐茜 张丽丽 李翠娥 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2026年第31期8264-8271,共8页
背景:近年来,外泌体长链非编码RNA逐渐成为骨质疏松机制研究的热点,外泌体与组织工程技术相结合在骨质疏松治疗药物、蛋白及RNA等小分子物质的靶向递送中发挥重要作用。目的:探讨外泌体治疗骨质疏松的作用机制,为骨质疏松提供新的治疗... 背景:近年来,外泌体长链非编码RNA逐渐成为骨质疏松机制研究的热点,外泌体与组织工程技术相结合在骨质疏松治疗药物、蛋白及RNA等小分子物质的靶向递送中发挥重要作用。目的:探讨外泌体治疗骨质疏松的作用机制,为骨质疏松提供新的治疗策略。方法:检索中国知网和PubMed数据库,中文检索词为“外泌体,长链非编码RNA,骨质疏松,细胞外囊泡,工程外泌体”等,英文检索词为“Exosomes,lncRNA,osteoporosis,extracellular vesicles,engineered exosomes”等,检索时限为各数据库建库至2025年7月,筛选出77篇文献进行分析总结。结果与结论:(1)骨髓、脂肪及其他组织细胞来源外泌体可通过递送长链非编码RNA调控miRNA及其下游信号通路,提高成骨细胞活性,增加骨质疏松小鼠皮质骨厚度和骨小梁数量,缓解骨质疏松;(2)通过敲降破骨细胞中长链非编码RNA,可缓解卵巢切除小鼠骨质疏松症状,减少骨质流失;(3)将骨靶向肽连接修饰在外泌体表面,可在骨质疏松小鼠体内发挥骨靶向和骨生成的作用,增强外泌体治疗骨质疏松的疗效;(4)其他体外增强外泌体作用的修饰物还有阿仑膦酸盐、双功能肽、金涂层磁性纳米粒子和重组益生菌等,可促进骨髓间充质干细胞和内皮祖细胞的成骨分化和血管生成;(5)将特定mRNA等核酸分子封装在经骨靶向肽修饰的外泌体中可显著增加骨靶向效率,减轻骨质疏松小鼠的骨质流失;(6)通过超声将姜黄素、虫草素和17β-雌二醇等药物加载到骨靶向肽修饰的外泌体中可发挥药物和外泌体治疗骨质疏松的协同作用,表现出比未加载药物的外泌体更显著的骨质疏松修复效果。 展开更多
关键词 外泌体 长链非编码RNA 骨质疏松 骨靶向肽 细胞外囊泡 工程外泌体 间充质干细胞 表面修饰
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增强子RNA的机制、表观遗传修饰以及在癌症中的功能作用 认领 引用 被引量：1
7
作者 黄春辉 李艳国 +1 位作者 邱美倩 廖奇 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 2026年第2期497-513,共17页
增强子RNA(enhancer RNA,eRNA)是由基因组增强子区域转录产生的功能性非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),在基因表达调控和癌症发生发展中发挥着重要作用。该文综述了eRNA的生物发生、作用机制、表观遗传修饰及其在癌症发生发展中的功能... 增强子RNA(enhancer RNA,eRNA)是由基因组增强子区域转录产生的功能性非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),在基因表达调控和癌症发生发展中发挥着重要作用。该文综述了eRNA的生物发生、作用机制、表观遗传修饰及其在癌症发生发展中的功能。在转录因子、共激活因子与RNA聚合酶II(RNA polymerase II,RNAP II)的协同作用下,增强子被激活并转录产生eRNA。eRNA可通过促进增强子–启动子环化、募集转录因子与转录复合物、调节染色质可及性等途径参与靶基因的转录调控。RNA修饰作为一种表观遗传调控方式,可以发生在包括eRNA在内的多种RNA上,影响其加工、稳定性与功能。多项研究表明,癌症中eRNA的表达谱常发生异常,这些改变可通过调控癌症相关基因表达,影响癌症的发生、进展与转移。深入了解eRNA的功能机制与表观遗传修饰特征,将有助于揭示新的表观遗传修饰调控网络,并为癌症的早期诊断与靶向治疗提供新的分子靶点。 展开更多
关键词 增强子RNA 非编码RNA 机制 RNA修饰 癌症 肿瘤发生
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表观遗传学在偏头痛致病与诊疗中的研究进展 认领 引用
8
作者 张孟曦 庞淼一 +3 位作者 王培培 李纤 王云 杨菲 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2026年第1期180-189,共10页
偏头痛是一种严重的慢性神经血管疾病,严重影响患者的生命质量,其病理生理机制复杂,受到基因和环境的共同影响,现有药物的治疗效果欠佳。表观遗传学是连接环境因素与遗传因素的重要桥梁,越来越多的研究发现表观遗传参与了偏头痛的先兆... 偏头痛是一种严重的慢性神经血管疾病,严重影响患者的生命质量,其病理生理机制复杂,受到基因和环境的共同影响,现有药物的治疗效果欠佳。表观遗传学是连接环境因素与遗传因素的重要桥梁,越来越多的研究发现表观遗传参与了偏头痛的先兆、发作与慢性化等过程,可作为偏头痛诊断与预后判断的生物标志物,为偏头痛治疗提供了潜在靶点。本文集中梳理了偏头痛表观遗传学领域的研究,以期发掘可信的偏头痛生物标志物与治疗靶点。 展开更多
关键词 偏头痛 表观遗传 DNA甲基化 组蛋白修饰 非编码RNA 生物标志物
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长非编码RNA MIR1915HG对胃癌细胞增殖和凋亡的影响和机制探索 认领 引用
9
作者 王璟 何学智 +4 位作者 王晶 王婵 刘星辰 刘博阳 苗登顺 《现代生物医学进展》 CAS 2026年第1期30-39,共10页
目的:探究长非编码RNA(LncRNA)MIR1915HG在胃癌发生发展中的作用及其潜在分子机制。方法:利用基因表达综合数据库(Gene expression omnibus,GEO,http://gffzz16a62c593b5540cescxq0ux59wkcx6c5c.ffgz.tsg.suse.edu.cn/gds)筛选,并通过qRT-PCR验证MIR1915HG在胃癌细胞系和临床... 目的:探究长非编码RNA(LncRNA)MIR1915HG在胃癌发生发展中的作用及其潜在分子机制。方法:利用基因表达综合数据库(Gene expression omnibus,GEO,http://gffzz16a62c593b5540cescxq0ux59wkcx6c5c.ffgz.tsg.suse.edu.cn/gds)筛选,并通过qRT-PCR验证MIR1915HG在胃癌细胞系和临床组织中的表达情况。采用oligo ASO技术敲低MIR1915HG,检测其对胃癌细胞增殖、周期和凋亡产生的影响。通过Western Blot分析相关通路蛋白的表达变化。探究MIR1915HG与N-乙酰转移酶NAT10、ac4C RNA修饰之间的调控关系。结果:MIR1915HG在胃癌细胞和组织中的表达显著增高。敲低MIR1915HG可以抑制胃癌细胞的增殖,导致细胞周期阻滞,并促进细胞凋亡,可能与细胞周期蛋白CDK4、凋亡蛋白Bax的表达改变有关。机制研究发现,MIR1915HG通过正向调控NAT10的表达来增加ac4C修饰水平,进而影响胃癌细胞的生物学行为。结论:LncRNA MIR1915HG在胃癌中高表达,可能通过NAT10/ac4C通路促进胃癌发生发展,为胃癌的早期诊断和分子靶向治疗提供了新的潜在靶点。 展开更多
关键词 胃癌 长非编码RNA MIR1915HG NAT10 ac4C修饰
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高同型半胱氨酸水平通过表观遗传学修饰介导动脉粥样硬化的机制 认领 引用
10
作者 周雪琪 郭海龙 +4 位作者 蔡文静 杨梦渠 张永海 李嘉仪 刘丹妮 《心血管病学进展》 CAS 2026年第5期417-422,共6页
血浆同型半胱氨酸(Hcy)水平升高目前已作为公认的动脉粥样硬化独立危险因素。伴随着炎症反应、氧化应激、内质网应激及自噬机制不断被证实,越来越多研究揭示,高Hcy水平可通过影响DNA甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA调控三种表观遗传学方... 血浆同型半胱氨酸(Hcy)水平升高目前已作为公认的动脉粥样硬化独立危险因素。伴随着炎症反应、氧化应激、内质网应激及自噬机制不断被证实,越来越多研究揭示,高Hcy水平可通过影响DNA甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA调控三种表观遗传学方式,促进动脉粥样硬化的病理生理发展。现综述Hcy通过表观遗传学修饰致动脉粥样硬化的研究进展,重点探讨其病理生理机制,旨在为靶向治疗动脉粥样硬化提供新的思路。 展开更多
关键词 高同型半胱氨酸 动脉粥样硬化 表观遗传学 DNA甲基化 组蛋白修饰 非编码RNA
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中药单体基于表观遗传调控乳腺癌的作用机制研究进展 认领 引用
11
作者 郭政丽 李自强 +2 位作者 许贺娟 曹雪炜 刘笑歌 《中国医药导报》 CAS 2026年第9期169-174,190,共6页
乳腺癌是一种严重危害女性健康的恶性肿瘤,其发病率和病死率很高。虽然乳腺癌的早期筛查和综合治疗可显著提高患者生存率,但部分患者的远期预后仍不容乐观。因此,深入探讨乳腺癌发生和发展的分子机制,挖掘有价值的关键靶点,对提高诊疗... 乳腺癌是一种严重危害女性健康的恶性肿瘤,其发病率和病死率很高。虽然乳腺癌的早期筛查和综合治疗可显著提高患者生存率,但部分患者的远期预后仍不容乐观。因此,深入探讨乳腺癌发生和发展的分子机制,挖掘有价值的关键靶点,对提高诊疗水平具有重要意义。表观遗传调控主要通过DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA调控等方式对基因表达进行可逆性调控,异常的表观遗传变化驱动乳腺肿瘤细胞的进展。乳腺癌的中医学归属于“乳岩”“乳石痈”等范畴,其多靶点、低毒性等独特优势,不仅可抑制肿瘤生长,还能改善患者临床症状,并提高其生活质量。中药单体是中药活性成分中的单一成分,可通过表观遗传机制调控DNA甲基化、组蛋白修饰及非编码RNA表达等环节,抑制乳腺癌细胞的增殖、侵袭及治疗耐药。本文系统综述表观遗传调控在乳腺癌中的分子机制,总结中药单体通过表观遗传调控乳腺癌,以期为乳腺癌的表观遗传机制研究及中药临床应用提供理论参考。 展开更多
关键词 中药单体 乳腺癌 表观遗传调控 DNA甲基化 组蛋白修饰 非编码RNA
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表观遗传学技术在脓毒症心肌损伤机制与治疗中的研究进展 认领 引用
12
作者 王晓璇 肖璐 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2026年第1期103-113,共11页
脓毒症心肌损伤(SIMI)是脓毒症常见且病死率极高的严重并发症,其发病机制尚未完全阐明,涉及过度炎症反应、线粒体功能障碍、细胞凋亡与氧化应激等多重病理过程。尽管目前临床以液体复苏、血管活性药物及抗炎等治疗为主要干预手段,但疗... 脓毒症心肌损伤(SIMI)是脓毒症常见且病死率极高的严重并发症,其发病机制尚未完全阐明,涉及过度炎症反应、线粒体功能障碍、细胞凋亡与氧化应激等多重病理过程。尽管目前临床以液体复苏、血管活性药物及抗炎等治疗为主要干预手段,但疗效有限且无法逆转表观遗传层面的病理性心脏重塑。通过系统地对DNA甲基化、组蛋白修饰(如乙酰化、甲基化)及非编码RNA调控等表观遗传学修饰与SIMI的相关研究进行总结论述。旨在为SIMI的早期预警、诊断、治疗及靶向药物开发提供新视角,改善SIMI患者的预后。 展开更多
关键词 脓毒症心肌损伤 表观遗传学 DNA甲基化 组蛋白修饰 非编码核糖核酸
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从机制到靶点:皮肤光老化的表观遗传调控研究进展 认领 引用
13
作者 潘洋 吕超 +6 位作者 苏维 孙宏印 张凌楠 杨先银 侯星华 王梅 印明柱 《皮肤性病诊疗学杂志》 2026年第6期462-470,共9页
皮肤光老化是紫外线辐射累积所致的皮肤加速衰老现象,其分子机制主要归因于氧化应激、DNA损伤及慢性炎症反应。近年来,随着表观遗传学研究的深入,人们对皮肤光老化发生机制的认识得以进一步拓展。表观遗传调控(包括DNA甲基化、组蛋白修... 皮肤光老化是紫外线辐射累积所致的皮肤加速衰老现象,其分子机制主要归因于氧化应激、DNA损伤及慢性炎症反应。近年来,随着表观遗传学研究的深入,人们对皮肤光老化发生机制的认识得以进一步拓展。表观遗传调控(包括DNA甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA调控及染色质重塑)不改变DNA序列的前提下,动态、可逆地调控基因表达,从而充当环境暴露与细胞表型之间的关键桥梁。本文系统性地阐述紫外线辐射如何通过干扰表观遗传过程,影响细胞外基质代谢、驱动细胞衰老与凋亡、加剧氧化应激与炎症反应等核心生物学进程,探讨表观遗传标志物在光老化早期诊断与风险预警中的潜力,并展望靶向表观遗传的防治策略,旨在深化对皮肤光老化表观遗传基础的理解,并为开发新型防治手段提供理论依据。 展开更多
关键词 皮肤光老化 表观遗传学 DNA甲基化 组蛋白修饰 非编码RNA
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Analysis of the Hox epigenetic code 认领 引用
14
作者 Zoheir Ezziane 《World Journal of Clinical Oncology》 2012年第4期48-56,共9页
Archetypes of histone modifications associated with diverse chromosomal states that regulate access to DNA are leading the hypothesis of the histone code(or epigenetic code).However,it is still not evident how these p... Archetypes of histone modifications associated with diverse chromosomal states that regulate access to DNA are leading the hypothesis of the histone code(or epigenetic code).However,it is still not evident how these post-translational modifications of histone tails lead to changes in chromatin structure.Histone modifications are able to activate and/or inactivate several genes and can be transmitted to next generation cells due to an epigenetic memory.The challenging issue is to identify or"decrypt"the code used to transmit these modifications to descent cells.Here,an attempt is made to describe how histone modifications operate as part of histone code that stipulates patterns of gene expression.This papers emphasizes particularly on the correlation between histone modifications and patterns of Hox gene expression in Caenorhabditis elegans.This work serves as an example to illustrate the power of the epigenetic machinery and its use in drug design and discovery. 展开更多
关键词 Epigenetic code Histone code Histone modifications Hox gene expression
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PlantEMS:A comprehensive database of epigenetic modification sites across multiple plant species 认领 引用 被引量：2
15
作者 Fuying Dao Xueqin Xie +20 位作者 Hongqi Zhang Zhengxing Guan Changchun Wu Wei Su Yijie Wei Feitong Hong Xinwei Luo Sijia Xie Hongyan Lai Dong Gao Yuhe Yang Yang Zhang Lin Ning Shihao Li Yuduo Hao Benjamin Lebeau Crystal Chia Yin Ling Jian Huang Melissa Jane Fullwood Hao Lin Hao Lv 《Plant Communications》 SCIE CSCD 2025年第4期8-11,共4页
Dear Editor,Epigenetic modifications are regulatory codes that control gene expression and can be stably inherited without alterations in the genomic sequence(Allis and Jenuwein,2016).Numerous studies have demonstrate... Dear Editor,Epigenetic modifications are regulatory codes that control gene expression and can be stably inherited without alterations in the genomic sequence(Allis and Jenuwein,2016).Numerous studies have demonstrated that epigenetic modifications regulate critical biological processes in plants,such as growth,development,response to environmental stressors,and reproduction(Zhang et al.,2023;Bulgakov,2024). 展开更多
关键词 regulatory codes genomic sequence allis epigenetic modifications growth plant species biological processes gene expression
叉头框蛋白O的调控及其在胃癌中的作用 认领 引用 被引量：2
16
作者 刘诗贺 宋奇赢 +1 位作者 张兰 郗洪庆 《生理科学进展》 CAS 北大核心 2025年第3期288-295,共8页
胃癌是我国最常见的上消化道恶性肿瘤之一,绝大多数患者在确诊时已处于进展期,临床预后较差。叉头框O(forkhead box O,FOXO)是一类广泛存在于真核生物中的转录因子,在发育、代谢以及恶性肿瘤的发生发展等多种生理和病理过程中发挥关键... 胃癌是我国最常见的上消化道恶性肿瘤之一,绝大多数患者在确诊时已处于进展期,临床预后较差。叉头框O(forkhead box O,FOXO)是一类广泛存在于真核生物中的转录因子,在发育、代谢以及恶性肿瘤的发生发展等多种生理和病理过程中发挥关键作用。临床研究发现,FOXO在胃癌中异常表达,并且与胃癌的增殖、迁移、治疗及耐药等密切相关。本文概述了FOXO的调控机制、FOXO在胃癌发生发展中的作用及其作为胃癌治疗靶点的可能性。 展开更多
关键词 FOXO 胃癌 凋亡 调控 非编码RNA 翻译后修饰 治疗靶点
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过表达促红细胞生成素人脐带间充质干细胞对缺血缺氧SH-SY5Y细胞凋亡的影响 认领 引用 被引量：1
17
作者 孔宁 唐吉祥 +7 位作者 侯豫博 孟澜 孙蕾 马保东 邵一鸣 靳冉冉 岳寒 张辉 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第36期7752-7761,共10页
背景:长链非编码RNA(LncRNA)在神经系统发育及神经性疾病中扮演着重要角色,课题组前期研究证明了缺血缺氧环境下过表达促红细胞生成素的人脐带间充质干细胞(EPO-MSCs)具有更好的神经保护功能,且显著激活了LncRNA XIST的表达。研究表明X... 背景:长链非编码RNA(LncRNA)在神经系统发育及神经性疾病中扮演着重要角色,课题组前期研究证明了缺血缺氧环境下过表达促红细胞生成素的人脐带间充质干细胞(EPO-MSCs)具有更好的神经保护功能,且显著激活了LncRNA XIST的表达。研究表明XIST与缺血缺氧脑病的发病机制有关,但其受EPO-MSCs调控进而保护缺血缺氧神经元的作用和机制尚不清楚。目的:探讨LncRNA XIST响应EPO-MSCs信号对缺血缺氧SH-SY5Y细胞凋亡影响的新机制。方法:(1)通过慢病毒转染构建敲低LncRNA XIST(sh-XIST)和阴性对照(NC-XIST)SH-SY5Y细胞株,采用氧-葡萄糖剥夺诱导细胞缺氧缺血损伤,使用Transwell小室构建EPO-MSCs和sh-XIST、NC-XIST缺血缺氧SH-SY5Y细胞非接触共培养体系,使用CCK-8方法检测SH-SY5Y细胞的增殖能力,使用细胞划痕实验检测SH-SY5Y细胞的迁移能力,使用流式细胞仪检测SH-SY5Y细胞凋亡情况。(2)RNA-seq生信分析筛选sh-XIST与NC-XIST细胞株差异表达基因和通路,利用双荧光素酶实验验证miR-124-3p与靶基因XIST和GRIN1之间的关系,通过qRT-PCR验证下游miR-124-3p、GRIN1基因的表达水平。(3)加入miR-124-3p抑制剂和模拟物验证缺血缺氧并与EPO-MSCs共培养后SH-SY5Y的表型变化。结果与结论:(1)与NC-XIST组相比,sh-XIST组SH-SY5Y细胞缺血缺氧损伤并与EPO-MSCs共培养后的增殖和迁移能力下降,细胞凋亡增加。(2)双荧光素酶实验结果显示,miR-124-3p与其靶基因XIST之间存在相互作用。在缺血缺氧条件下,转染miR-124-3p mimics的SH-SY5Y细胞在与EPO-MSCs共培养后表现出细胞凋亡减少的情况;相反,当SH-SY5Y细胞转染miR-124-3p inhibitor时,在相同的缺血缺氧条件及与EPO-MSCs共培养的情况下,细胞凋亡则显著增加。(3)通过对sh-XIST进行转录组测序和生物信息学分析筛选得到显著下调的神经活性配体-受体通路及中枢神经系统发育关键受体基因GRIN1。(4)双荧光素酶实验结果显示,miR-124-3p与GRIN1相互作用,与NC-XIST组相比,缺血缺氧后sh-XIST组SH-SY5Y细胞GRIN1表达显著下调。结果表明,LncRNA XIST通过上调miR-124-3p从而促进GRIN1表达,进而减少缺血缺氧并与EPO-MSCs共培养SH-SY5Y细胞凋亡,增强其增殖、迁移能力;sh-XIST可以阻断这一保护功能。 展开更多
关键词 缺血缺氧脑病 促红细胞生成素 脐带间充质干细胞 长链非编码RNA 基因修饰 XIST miR-124-3p GRIN1 工程化干细胞
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糖尿病心肌病的表观遗传学研究进展 认领 引用
18
作者 胡娜娜 门冰欣 +3 位作者 张亚苹 王一华 蒋玉娇 张锦 《生命的化学》 CAS 2025年第9期1788-1797,共10页
糖尿病心肌病(diabetic cardiomyopathy,DCM)是糖尿病的严重并发症,已成为全球糖尿病患者的主要死因之一。由于DCM分子机制的复杂性以及关键调控机制尚未完全阐明,DCM治疗靶点和药物研发面临诸多挑战。表观遗传学作为一种新兴的研究领域... 糖尿病心肌病(diabetic cardiomyopathy,DCM)是糖尿病的严重并发症,已成为全球糖尿病患者的主要死因之一。由于DCM分子机制的复杂性以及关键调控机制尚未完全阐明,DCM治疗靶点和药物研发面临诸多挑战。表观遗传学作为一种新兴的研究领域,主要研究在DNA序列不变的情况下,基因表达发生的可遗传改变,涉及DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA调控等多种机制。研究表明,表观遗传修饰在DCM的发病过程中发挥重要作用。本文重点围绕DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA调控三个方面,对DCM相关的表观遗传学机制研究现状进行综述,旨在从表观遗传学的角度为深入阐释DCM的发病机制提供理论参考。 展开更多
关键词 糖尿病心肌病 表观遗传修饰 非编码RNA DNA甲基化 组蛋白修饰
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m6A甲基化修饰在肝细胞癌治疗中的作用研究进展 认领 引用
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作者 史晶晶 时博 王小兰 《中国新药与临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2025年第4期252-257,共6页
N6-甲基腺苷(m6A)甲基化修饰参与mRNA生物学行为的全过程,在癌症的恶性进展中发挥了重要作用。本文对m6A甲基化修饰在肝细胞癌(HCC)的侵袭、发生、发展与转移中的作用,以及与非编码RNA之间的调控、免疫治疗作用进行综述。有关HCC的m6A... N6-甲基腺苷(m6A)甲基化修饰参与mRNA生物学行为的全过程,在癌症的恶性进展中发挥了重要作用。本文对m6A甲基化修饰在肝细胞癌(HCC)的侵袭、发生、发展与转移中的作用,以及与非编码RNA之间的调控、免疫治疗作用进行综述。有关HCC的m6A甲基化修饰的调控蛋白,在HCC的发生、发展、转移以及预后是至关重要的;m6A甲基化修饰调节与非编码RNA之间的互相调控,与HCC的增殖、转移以及耐药性密切相关;在免疫治疗方面,最新发现的circRHBDD1与BTBD10参与m6A甲基化修饰调控的细胞代谢,抑制肿瘤细胞的免疫逃逸,该领域的研究可用于未来HCC的诊断与创新药物发现。 展开更多
关键词 m6A甲基化修饰 肝细胞癌 非编码RNA 免疫治疗 circRHBDD1 BTBD10
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早期胚胎发育母源向合子转换的调控机制研究进展 认领 引用
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作者 张武文 李凯 +3 位作者 尹萍 钟秀芳 李赟 严骅 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 2025年第8期2105-2115,共11页
早期胚胎发育是一个高度精细且有序的过程,涉及多个关键的细胞和分子事件。这些事件包括起始母源物质的降解、合子基因组的激活、母源向合子转换(MZT)以及细胞命运的分化等。当前研究表明,母源物质的降解与合子基因组的激活是一个动态... 早期胚胎发育是一个高度精细且有序的过程,涉及多个关键的细胞和分子事件。这些事件包括起始母源物质的降解、合子基因组的激活、母源向合子转换(MZT)以及细胞命运的分化等。当前研究表明,母源物质的降解与合子基因组的激活是一个动态且复杂的过程,这一过程对MZT的顺利转换至关重要,涉及多种调控机制,包括DNA甲基化、非编码RNA和组蛋白修饰等。同时,MZT是早期胚胎发育过程中的关键转折点,且与胚胎的正常发育及其后续生物功能密切相关。近年来,研究者们在MZT机制方面取得了显著进展,但与此同时,仍存在一些未解之谜,例如不同物种之间MZT过程的差异以及各调控因子的具体作用机制。该文旨在总结和分析母源物质的降解、合子基因组的激活及其相关调控因子在MZT中的作用,探讨不同模式生物的共性与差异,并为深入理解MZT的分子机制提供新的视角。 展开更多
关键词 早期胚胎发育 母源物质降解 合子基因组激活 母源向合子转换 DNA甲基化 非编码RNA 组蛋白修饰
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