期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
摘要
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
共找到60篇文章
< 1 2 3 >
每页显示 20 50 100
已选0条
引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
水稻苗期耐冷性Meta-QTL分析及候选基因预测 认领 引用
1
作者 王洋洋 杨传铭 +6 位作者 张喜娟 杨贤莉 王立志 崔士泽 许鑫凯 李红宇 姜树坤 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2026年第3期312-326,共15页
【目的】挖掘鉴定耐冷基因进而选育耐冷品种是解决水稻低温冷害难题的最简单、直接和有效的手段之一。利用Meta-QTL分析可以有效整合不同遗传背景下控制水稻耐冷等农艺性状的基因位点,提高候选基因定位的精度和可靠性,为水稻耐冷基因的... 【目的】挖掘鉴定耐冷基因进而选育耐冷品种是解决水稻低温冷害难题的最简单、直接和有效的手段之一。利用Meta-QTL分析可以有效整合不同遗传背景下控制水稻耐冷等农艺性状的基因位点,提高候选基因定位的精度和可靠性,为水稻耐冷基因的克隆和育种利用提供数据支撑。【方法】本研究收集并整理了38项独立研究中的353个水稻苗期耐冷相关QTL,利用BioMercator 4.2软件对QTL关键信息进行整合分析。并利用GO分析和KEGG分析对鉴定的Meta-QTL进行候选基因挖掘。【结果】共鉴定出了82个Meta-QTL,其中67个(81.71%)的置信区间小于1 Mb,共包含9282个注释基因,包括已报道的25个苗期耐冷基因。利用GO分析筛选出了99、230和119个分别与非生物逆境应答、环境胁迫反应和转录因子相关的基因。进一步利用KEGG富集筛选出27、69和9个分别与非生物逆境应答、胁迫反应和转录因子相关的差异显著性基因。【结论】对353个苗期耐冷QTL进行整合分析鉴定出82个苗期耐冷Meta-QTL,GO分析确定了448个候选基因,KEGG进一步确定了105个差异表达候选基因。上述结果为水稻苗期耐冷的分子标记辅助育种和基因克隆提供有用的信息。 展开更多
关键词 水稻 耐冷性 数量性状位点 Meta分析 候选基因
暂未订购 下载PDF
玉米茎秆倒伏相关性状 Meta-QTL 分析及候选基因初步验证 认领 引用
2
作者 房海悦 栾天宇 +8 位作者 王雪 曲文利 张春宵 周小辉 董菁 李淑芳 刘学岩 李晓辉 金峰学 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2025年第8期35-44,共10页
借助IBM22008 neighbors高密度遗传图谱整合802个玉米茎秆倒伏相关QTL,采用元分析方法获得64个MQTL(meta quantitative trait loci,MQTL),覆盖玉米全基因组。与水稻抗倒伏基因同源比对获得5个玉米茎秆倒伏相关候选基因,分别定位在玉米第... 借助IBM22008 neighbors高密度遗传图谱整合802个玉米茎秆倒伏相关QTL,采用元分析方法获得64个MQTL(meta quantitative trait loci,MQTL),覆盖玉米全基因组。与水稻抗倒伏基因同源比对获得5个玉米茎秆倒伏相关候选基因,分别定位在玉米第1、3、4和9染色体上。通过基因表达分析表明,5个候选基因可能参与茎秆发育生物学过程,进而调控对茎秆机械强度。玉米茎秆倒伏相关性状MQTL及候选基因分析可以为分子标记辅助育种及相关基因克隆提供信息。 展开更多
关键词 玉米 茎秆倒伏 元分析 Meta-QTL 候选基因
暂未订购 下载PDF
玉米产量相关性状Meta-QTL及候选基因分析 认领 引用 被引量：22
3
作者 江培顺 张焕欣 +9 位作者 吕香玲 郝转芳 李博 李明顺 王宏伟 慈晓科 张世煌 李新海 史振声 翁建峰 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期969-978,共10页
借助IBM2 2008 Neighbors高密度玉米遗传图谱整合了1994—2012年文献发表的玉米产量性状(穗行数、行粒数、粒重)584个QTL。采用元分析方法,确定了22个穗行数、7个行粒数和44个粒重Meta-QTL。根据B73基因组序列进行产量相关基因的重定位,... 借助IBM2 2008 Neighbors高密度玉米遗传图谱整合了1994—2012年文献发表的玉米产量性状(穗行数、行粒数、粒重)584个QTL。采用元分析方法,确定了22个穗行数、7个行粒数和44个粒重Meta-QTL。根据B73基因组序列进行产量相关基因的重定位,在Meta-QTL区段内分别获得10个玉米产量基因和12个与水稻7个产量基因同源的候选基因,分别位于玉米染色体Bins1.04、1.06、1.07、2.04、2.06、3.04、4.05、4.07、4.09、5.03、5.04、5.05、7.02、8.03、9.03、10.06和10.07。玉米产量性状Meta-QTL及相关候选基因分析可以为分子标记辅助育种和基因克隆提供有用的信息。 展开更多
关键词 玉米 产量性状 元分析 Meta-QTL 候选基因
暂未订购 下载PDF
玉米叶形相关性状的Meta-QTL及候选基因分析 认领 引用 被引量：16
4
作者 郭书磊 张君 +8 位作者 齐建双 岳润清 韩小花 燕树锋 卢彩霞 傅晓雷 陈娜娜 库丽霞 铁双贵 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期487-501,共15页
叶长、叶宽、叶面积及叶夹角不仅影响玉米(Zea mays)光合效率,也是株型的重要构成因素。通过对620个叶形QTL进行整合,构建不同遗传背景下的叶形QTL整合图谱,利用元分析发掘出22个叶长、22个叶宽、12个叶面积以及17个叶夹角m QTL;进一步... 叶长、叶宽、叶面积及叶夹角不仅影响玉米(Zea mays)光合效率,也是株型的重要构成因素。通过对620个叶形QTL进行整合,构建不同遗传背景下的叶形QTL整合图谱,利用元分析发掘出22个叶长、22个叶宽、12个叶面积以及17个叶夹角m QTL;进一步运用生物信息学手段,确定44个与叶片发育密切相关的候选基因。分析发现,仅有NAL7-like、YABBY6-like和GRF2等13个基因位于m QTL区间内,而玉米中已克隆的KNOTTED1、AN3/GIF1、rgd1/lbl1、mwp1及SRL2-like、HYL1-like和CYCB2;4-like等水稻(Oryza sativa)和拟南芥(Arabidopsis thaliana)叶形同源基因位于未被整合的QTL内;对44个候选基因在叶片长、宽、厚发育过程中基部-末端、中央-边缘、远轴-近轴的调控机理进行归纳分析,发现玉米中仅有少数几个候选基因被报道,揭示了叶形发育的部分分子机理。因此,对玉米叶形相关m QTL/QTL及基因进行全面深入的分析,不仅有助于增加对其遗传结构的了解,发掘更多候选基因,阐明叶形发育和形成的分子机制,还可为耐密理想株型的分子标记辅助选择提供依据。 展开更多
关键词 玉米 叶长 叶宽 叶面积 叶夹角 元分析 meta-QTL 候选基因
暂未订购 下载PDF
玉米产量相关性状定位和Meta-QTL整合 认领 引用 被引量：9
5
作者 马娟 王浩 +5 位作者 王利锋 曹言勇 李晶晶 Thomas Lubberstedt 王丽艳 李会勇 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期37-47,共11页
以自交系PHB47为轮回亲本,美国GEM种质YUCATAN TOL389 ICA为供体,构建包含115个株系的BC3F4群体为材料,利用玉米56K SNP芯片鉴定基因型,采用基于似然比测验的逐步回归分析法,对产量相关性状进行QTL定位分析。共获得7个穗粒数、穗长、粒... 以自交系PHB47为轮回亲本,美国GEM种质YUCATAN TOL389 ICA为供体,构建包含115个株系的BC3F4群体为材料,利用玉米56K SNP芯片鉴定基因型,采用基于似然比测验的逐步回归分析法,对产量相关性状进行QTL定位分析。共获得7个穗粒数、穗长、粒宽、株高和穗位高加性QTL,解释3.72%～21.90%的表型变异;5个控制单穗重、百粒重、穗长和株高的显性QTL,表型变异解释率为8.40%～21.90%。同时,利用Meta-QTL分析方法,对2005-2018年已发表的不同环境条件下产量相关性状QTL的定位结果进行了整合分析。在正常田间管理条件和营养胁迫条件分别获得37个和16个MQTL。本研究中穗位高加性位点AX-116871591位于MQTL16区段内,并且与MQTLNP7位置相近,该区段内包含生长素/脱落酸转录因子IAA5。穗粒数加性位点AX-86281411,粒宽加性位点AX-86267702和株高显性位点AX-116875920均位于MQTLNP9区段内,该区段内包含NAC转录因子NACTF36。NAC转录因子、MYB转录因子和SOD基因均存在于两个环境条件MQTL区段内。 展开更多
关键词 玉米 产量 56KSNP芯片 Meta-QTL分析
暂未订购 下载PDF
Integration of meta-QTL discovery with omics: Towards a molecular breeding platform for improving wheat resistance to Fusarium head blight 认领 引用 被引量：13
6
作者 Tong Zheng Chen Hua +5 位作者 Lei Li Zhengxi Sun Minmin Yuan Guihua Bai Gavin Humphreys Tao Li 《The Crop Journal》 SCIE CSCD 2021年第4期739-749,共11页
Fusarium head blight(FHB) is a global wheat disease that devastates wheat production. Resistance to FHB spread within a wheat spike(type Ⅱ resistance) and to mycotoxin accumulation in infected kernel(type Ⅲ resistan... Fusarium head blight(FHB) is a global wheat disease that devastates wheat production. Resistance to FHB spread within a wheat spike(type Ⅱ resistance) and to mycotoxin accumulation in infected kernel(type Ⅲ resistance) are the two main types of resistance. Of hundreds of QTL that have been reported, only a few can be used in wheat breeding because most show minor and/or inconsistent effects in different genetic backgrounds. We describe a new strategy for identifying robust and reliable meta-QTL(mQTL)that can be used for improvement of wheat FHB resistance. It involves integration of mQTL analysis with mQTL physical mapping and identification of single-copy markers and candidate genes. Using metaanalysis, we consolidated 625 original QTL from 113 publications into 118 genetic map-based mQTL(gmQTL). These gmQTL were further located on the Chinese Spring reference sequence map. Finally, 77 high-confidence mQTL(hcmQTL) were selected from the reference sequence-based mQTL(smQTL).Locus-specific single nucleotide polymorphism(SNP) and simple sequence repeat(SSR) markers and17 genes responsive to FHB were then identified in the hcmQTL intervals by combined analysis of transcriptomic and proteomic data. This work may lead to a comprehensive molecular breeding platform for improving wheat resistance to FHB. 展开更多
关键词 Wheat Fusarium head blight High-confidence meta-QTL Omics
暂未订购 下载PDF
玉米籽粒蛋白含量Meta-QTL及候选基因分析 认领 引用 被引量：6
7
作者 宝华宾 梁帅强 +1 位作者 吕远大 赵涵 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第4期736-745,共10页
玉米的蛋白含量与品质直接相关,可通过各种遗传群体对籽粒蛋白进行QTL分析。但是由于使用不同的遗传图谱和分子标记,结果之间无法直接比较分析,数据也无法整合和利用。为了综合、系统分析玉米籽粒蛋白的QTL位点,收集和整理了289个已报... 玉米的蛋白含量与品质直接相关,可通过各种遗传群体对籽粒蛋白进行QTL分析。但是由于使用不同的遗传图谱和分子标记,结果之间无法直接比较分析,数据也无法整合和利用。为了综合、系统分析玉米籽粒蛋白的QTL位点,收集和整理了289个已报道的玉米籽粒蛋白含量QTL相关信息,采用Bio Mercator4.2软件整合不同遗传图谱,通过元分析发掘到44个meta-QTL(MQTL),研究确定了13个在不同遗传群体间具有一致性的QTL位点。利用生物信息学注释一致性QTL位点区段相关候选基因的功能,获得了847个候选基因,功能富集化分析发现13个候选基因显著富集在9个生物学过程中。这些meta-QTL位点及相关候选基因分析可以为玉米籽粒蛋白的分子标记辅助育种、精细定位和基因克隆提供有用的信息。 展开更多
关键词 玉米 籽粒蛋白 元分析 meta-QTL 候选基因
暂未订购 下载PDF
Meta-QTL analysis for mining of candidate genes and constitutive gene network development for fungal disease resistance in maize(Zea mays L.) 认领 引用 被引量：2
8
作者 Mamta Gupta Mukesh Choudhary +3 位作者 Alla Singh Seema Sheoran Deepak Singla Sujay Rakshit 《The Crop Journal》 SCIE CSCD 2023年第2期511-522,共12页
The development of resistant maize cultivars is the most effective and sustainable approach to combat fungal diseases.Over the last three decades,many quantitative trait loci(QTL)mapping studies reported numerous QTL ... The development of resistant maize cultivars is the most effective and sustainable approach to combat fungal diseases.Over the last three decades,many quantitative trait loci(QTL)mapping studies reported numerous QTL for fungal disease resistance(FDR)in maize.However,different genetic backgrounds of germplasm and differing QTL analysis algorithms limit the use of identified QTL for comparative studies.The meta-QTL(MQTL)analysis is the meta-analysis of multiple QTL experiments,which entails broader allelic coverage and helps in the combined analysis of diverse QTL mapping studies revealing common genomic regions for target traits.In the present study,128(33.59%)out of 381 reported QTL(from 82 studies)for FDR could be projected on the maize genome through MQTL analysis.It revealed 38 MQTL for FDR(12 diseases)on all chromosomes except chromosome 10.Five MQTL namely 1_4,2_4,3_2,3_4,and 5_4 were linked with multiple FDR.Total of 1910 candidate genes were identified for all the MQTL regions,with protein kinase gene families,TFs,pathogenesis-related,and disease-responsive proteins directly or indirectly associated with FDR.The comparison of physical positions of marker-traits association(MTAs)from genome-wide association studies with genes underlying MQTL interval verified the presence of QTL/candidate genes for particular diseases.The linked markers to MQTL and putative candidate genes underlying identified MQTL can be further validated in the germplasm through marker screening and expression studies.The study also attempted to unravel the underlying mechanism for FDR resistance by analyzing the constitutive gene network,which will be a useful resource to understand the molecular mechanism of defense-response of a particular disease and multiple FDR in maize. 展开更多
关键词 Meta-QTL Maize genome Fungal disease resistance Candidate gene Constitutive genes Gene network
暂未订购 下载PDF
玉米雄穗分枝数Meta-QTL及候选基因分析 认领 引用
9
作者 曲文利 房海悦 +6 位作者 张春宵 周小辉 董菁 李淑芳 刘学岩 李晓辉 金峰学 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期17-22,共6页
雄穗分枝数是影响玉米产量及抗逆性的重要因素之一,挖掘玉米雄穗分枝数相关基因对玉米品种改良及分子标记辅助育种具有重要的意义。借助IBM22008 Neighbors高密度玉米遗传图谱整合26篇已发表文献中定位的188个玉米雄穗分枝数QTL,采用元... 雄穗分枝数是影响玉米产量及抗逆性的重要因素之一,挖掘玉米雄穗分枝数相关基因对玉米品种改良及分子标记辅助育种具有重要的意义。借助IBM22008 Neighbors高密度玉米遗传图谱整合26篇已发表文献中定位的188个玉米雄穗分枝数QTL,采用元分析方法获得14个Meta-QTL(MQTL),经与水稻花序相关基因同源比对,获得4个玉米雄穗分枝数相关候选基因,分别位于玉米第2、7和8染色体上。玉米雄穗分枝数Meta-QTL及相关候选基因分析,可以为分子标记辅助育种及相关基因克隆提供实用信息。 展开更多
关键词 玉米 雄穗分枝数 元分析 Meta-QTL 候选基因
暂未订购 下载PDF
Identification of candidate genes controlling fiber quality traits in upland cotton through integration of meta-QTL,significant SNP and transcriptomic data 认领 引用 被引量：2
10
作者 XU Shudi PAN Zhenyuan +6 位作者 YIN Feifan YANG Qingyong LIN Zhongxu WEN Tianwang ZHU Longfu ZHANG Dawei NIE Xinhui 《Journal of Cotton Research》 CAS 2020年第4期324-335,共12页
Background:Meta-analysis of quantitative trait locus(QTL)is a computational technique to identify consensus QTL and refine QTL positions on the consensus map from multiple mapping studies.The combination of meta-QTL i... Background:Meta-analysis of quantitative trait locus(QTL)is a computational technique to identify consensus QTL and refine QTL positions on the consensus map from multiple mapping studies.The combination of meta-QTL intervals,significant SNPs and transcriptome analysis has been widely used to identify candidate genes in various plants.Results:In our study,884 QTLs associated with cotton fiber quality traits from 12 studies were used for meta-QTL analysis based on reference genome TM-1,as a result,74 meta-QTLs were identified,including 19 meta-QTLs for fiber length;18 meta-QTLs for fiber strength;11 meta-QTLs for fiber uniformity;11 meta-QTLs for fiber elongation;and 15 meta-QTLs for micronaire.Combined with 8589 significant single nucleotide polymorphisms associated with fiber quality traits collected from 15 studies,297 candidate genes were identified in the meta-QTL intervals,20 of which showed high expression levels specifically in the developing fibers.According to the function annotations,some of the 20 key candidate genes are associated with the fiber development.Conclusions:This study provides not only stable QTLs used for marker-assisted selection,but also candidate genes to uncover the molecular mechanisms for cotton fiber development. 展开更多
关键词 Fiber quality traits Meta-QTL Significant SNPs Candidate genes Transcriptomic data
暂未订购 下载PDF
玉米耐旱相关性状Meta-QTL及候选基因表达分析 认领 引用
11
作者 郭长顺 李晓辉 +3 位作者 张春宵 崔海燕 金峰学 具红光 《延边大学农学学报》 2022年第2期29-35,共7页
该研究借助高密度分子标记遗传图谱IBM 22008 Neighbors,在正常水分条件下搜集并整合了来自17个不同作图群体的211个玉米耐旱性状相关QTL。通过元分析方法获得39个与玉米耐旱相关的“一致性”QTL(Meta-QTL)。经与水稻已克隆的耐旱相关... 该研究借助高密度分子标记遗传图谱IBM 22008 Neighbors,在正常水分条件下搜集并整合了来自17个不同作图群体的211个玉米耐旱性状相关QTL。通过元分析方法获得39个与玉米耐旱相关的“一致性”QTL(Meta-QTL)。经与水稻已克隆的耐旱相关基因进行同源对比,在MQTL区段内找到6个玉米耐旱候选基因,分别为Zm00001d038453、Zm00001d034601、Zm00001d023294、Zm00001d037112、Zm00001d019230和Zm00001d045384。 展开更多
关键词 玉米 抗旱性 元分析 Meta-QTL 候选基因
暂未订购 下载PDF
Genome-wide association study reveals genomic regions for nitrogen,phosphorus and potassium use efficiency in bread wheat 认领 引用
12
作者 Jili Xu Shuo Liu +4 位作者 Zhiyuan Gao Qingdong Zeng Xiaowen Zhang Dejun Han Hui Tian 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2026年第3期847-863,共17页
The development of wheat cultivars with improved nitrogen(N),phosphorus(P),and potassium(K)use efficiency is essential for sustainable agriculture.Genetic dissection and identification of causative genes underlying nu... The development of wheat cultivars with improved nitrogen(N),phosphorus(P),and potassium(K)use efficiency is essential for sustainable agriculture.Genetic dissection and identification of causative genes underlying nutrient use efficiency represent a key strategy toward this goal.We conducted an extensive genome-wide association study(GWAS)using a panel of 431 wheat cultivars,identifying 1,659 significant single-nucleotide polymorphisms(SNPs)(LOD>5)through genotyping-by-sequencing.This analysis revealed 534 quantitative trait loci(QTLs)associated with 12 nutrient use efficiency traits across five distinct environments,among which 14 QTLs were consistently detected in at least three environments.Notably,meta-QTL analysis,showed that QTL80(72.12–74.24 Mb,chr2A),QTL387(32.88–33.56 Mb,chr6A),and QTL500(535.53–540.80 Mb,chr7B)exhibit clear co-localization with MQTL-2A-2,MQTL-6A-1,and MQTL-7B-2,respectively.This overlap highlights their robustness across diverse environmental conditions.Within these regions,critical candidate genes-including members of the bZIP transcription factor family and a potassium transporter gene-were identified in relation to nutrient use efficiency.Furthermore,a novel locus,QTL234,was discovered,harboring key candidate genes such as dof zinc finger protein,Ankyrin repeat family protein,and cytochrome P450.To validate the SNP within QTL234 associated with nitrogen harvest index(NHI),we developed a dCAPS marker for AX-109095537.These findings demonstrate the effectiveness of high-resolution SNP-based GWAS in rapidly pinpointing promising candidate genes.They also establish a foundation for large-scale QTL fine mapping,candidate gene validation,and the development of functional markers essential for enhancing nutrient use efficiency in wheat breeding programs. 展开更多
关键词 wheat genome-wide association study nutrient use efficiency meta-QTL analysis candidate genes
暂未订购 下载PDF
棉花纤维品质相关性状QTL元分析及候选基因鉴定 认领 引用
13
作者 郭栋财 吕涛 +4 位作者 蔡永生 买吾鲁达·艾合买提 陈全家 曲延英 郑凯 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2025年第6期1445-1466,共22页
棉花纤维品质性状是受多基因控制的复杂数量性状,深入挖掘棉花纤维品质数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)和候选基因对棉花纤维品质遗传改良具有重要意义。本研究利用BioMercator 4.2软件,以Blenda A等发布的棉花高密度分子... 棉花纤维品质性状是受多基因控制的复杂数量性状,深入挖掘棉花纤维品质数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)和候选基因对棉花纤维品质遗传改良具有重要意义。本研究利用BioMercator 4.2软件,以Blenda A等发布的棉花高密度分子标记遗传连锁图谱为参考图谱,对来自21个独立纤维品质QTL定位研究中的379个控制棉花纤维品质的原始QTL进行图谱整合、映射以及QTL元分析。获得的74个控制棉花纤维品质性状的一致性meta-QTL(meta quantitative trait loci,MQTL),分布在26条染色体上,置信区间最小为0.5 cM,所有MQTL中共包含13,833个基因。通过RNA-seq、GO和KEGG富集分析,挖掘到32个与棉花纤维品质相关的候选基因。通过qRT-PCR验证发现,这些基因在棉花纤维发育不同时期差异表达,推测其可能参与调控棉花纤维发育。本研究为棉花纤维品质性状分子标记辅助选择育种和基因克隆提供理论依据。 展开更多
关键词 棉花 纤维品质 一致性QTL 元分析
暂未订购 下载PDF
基于元分析的大豆含硫氨基酸相关基因挖掘与信息学分析 认领 引用 被引量：7
14
作者 邱红梅 厉志 +7 位作者 于妍 高淑芹 马晓萍 郑宇宏 孟凡凡 侯云龙 王跃强 王曙明 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期141-147,共7页
提高含硫氨基酸组分是大豆品质改良的重要目标之一。本文借助Consensus Map 4.0高密度大豆遗传图谱,整合了33个含硫氨基酸QTL,并采用元分析方法,确定了8个含硫氨基酸Meta-QTL。通过QTL序列共线性区间分析,在Meta-QTL内筛选到7条用于候... 提高含硫氨基酸组分是大豆品质改良的重要目标之一。本文借助Consensus Map 4.0高密度大豆遗传图谱,整合了33个含硫氨基酸QTL,并采用元分析方法,确定了8个含硫氨基酸Meta-QTL。通过QTL序列共线性区间分析,在Meta-QTL内筛选到7条用于候选基因发掘的基因组序列。利用基因功能注释,得到16个含硫氨基酸相关基因,包括6个氨基酸合成途径酶基因、1个11S大豆球蛋白A5A4B3亚基基因及9个调控基因。其中调控基因分别编码F-Box、PPR及转录因子3种蛋白。13个基因在NCBI数据库中分别有表达谱及SNP信息。大豆含硫氨基酸候选基因分析,可以为功能标记的开发和分子辅助育种提供有用信息。 展开更多
关键词 大豆 含硫氨基酸 元分析 Meta-QTL 候选基因
暂未订购 下载PDF
利用SNP标记高密度遗传图谱进行花生出仁率QTL定位 认领 引用 被引量：6
15
作者 周小静 董洋 +9 位作者 张芳 任小平 陈玉宁 黄莉 陈伟刚 廖伯寿 雷永 晏立英 罗怀勇 姜慧芳 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期750-756,共7页
为进一步明确出仁率遗传基础,本研究以出仁率性状有显著差异的两亲本中花5号和ICGV 86699衍生的RIL群体为材料,以其表型数据结合栽培花生第一张基于SNP标记的高密度遗传图谱,采用Windows QTL Cartographer V.2.5软件的复合区间作图法,对... 为进一步明确出仁率遗传基础,本研究以出仁率性状有显著差异的两亲本中花5号和ICGV 86699衍生的RIL群体为材料,以其表型数据结合栽培花生第一张基于SNP标记的高密度遗传图谱,采用Windows QTL Cartographer V.2.5软件的复合区间作图法,对3个单环境及联合环境下出仁率进行QTL定位,共检测到28个QTL。各QTL解释的表型变异为3.98%-13.77%,LOD值介于2.59-7.36之间,其中6个为贡献率大于10.0%的主效QTL。Meta-QTL分析鉴定出7个在不同环境下都能稳定表达的一致性QTL。其中一致性QTL cqSPA4b在3个单环境和联合环境中都能检测到,一致性QTL cq SPB6a在3个单环境中能检测到,且平均贡献率为11.86%。与前人的研究结果比较发现,cq SPA5b与另外两个不同群体鉴定出的A5染色体上出仁率QTL区间相似。本研究结果为出仁率QTL的精细定位及分子标记辅助育种奠定了良好基础。 展开更多
关键词 花生 出仁率 QTL定位 SNP标记图谱 meta-QTL分析
暂未订购 下载PDF
大豆共生结瘤相关性状QTL定位信息整合及候选基因分析 认领 引用 被引量：6
16
作者 张艳娇 李长育 +11 位作者 王锦辉 常慧琳 魏玮 马超 姜志浩 蒋洪蔚 刘春燕 尹振功 高山 金喜军 辛大伟 陈庆山 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期580-588,共9页
目前基于大豆共生结瘤QTL定位的结果少、置信区间大,难以应用于实践中,因此整合前人研究结果、缩短置信区间具有重要意义。本研究针对大豆共生结瘤相关性状,搜集国内外已报道的48个QTL定位结果,利用Meta分析得到2个分别控制结瘤数目、... 目前基于大豆共生结瘤QTL定位的结果少、置信区间大,难以应用于实践中,因此整合前人研究结果、缩短置信区间具有重要意义。本研究针对大豆共生结瘤相关性状,搜集国内外已报道的48个QTL定位结果,利用Meta分析得到2个分别控制结瘤数目、结瘤大小和结瘤干鲜重的Meta-QTL。在区间内选择候选基因,利用野生大豆和栽培大豆验证候选基因在接种根瘤菌后的表达模式,明确候选基因与共生结瘤的关系。对Meta-QTL区间内的6个候选基因进行qRT-PCR检测及初步生物信息学分析,结果表明其中4个基因有可能为大豆共生结瘤性状的候选基因。本研究的实验方法对QTL定位区间内候选基因的确定和功能研究具有指导意义。 展开更多
关键词 大豆 结瘤 Meta分析 Meta-QTL
暂未订购 下载PDF
Surveying the genomic landscape of silage-quality traits in maize(Zea mays L.) 认领 引用
17
作者 Jatin Sharma Shubham Sharma +8 位作者 Krishna Sai Karnatam Om Prakash Raigar Chayanika Lahkar Dinesh Kumar Saini Sushil Kumar Alla Singh Abhijit Kumar Das Priti Sharma Ramesh Kumar 《The Crop Journal》 SCIE CSCD 2023年第6期1893-1901,共9页
Despite the longstanding importance of silage as a critical feed source for ruminants,its quality improvement has been largely overlooked.Although numerous quantitative trait loci(QTL)and genes affecting silage qualit... Despite the longstanding importance of silage as a critical feed source for ruminants,its quality improvement has been largely overlooked.Although numerous quantitative trait loci(QTL)and genes affecting silage quality in maize have been reported,only a few have been effectively incorporated into breeding programs.Addressing this gap,the present study undertook a comprehensive meta-QTL(MQTL)analysis involving 523 QTL associated with silage-quality traits collected from 14 published studies.Of the 523 QTL,405 were projected onto a consensus map comprising 62,424 genetic markers,resulting in the identification of 60 MQTL and eight singletons.The average confidence interval(CI)of the MQTL was 3.9-fold smaller than that of the source QTL.Nine of the 60 identified MQTL were classified as breeder’s MQTL owing to their small CIs,involvement of more QTL,and large contribution to phenotypic variation.One-third of the MQTL co-localized with DNA marker-trait associations identified in previous genomewide association mapping studies.A set of 78 high-confidence candidate genes influencing silage quality were identified in the MQTL regions.These genes and associated markers may advance marker-assisted breeding for maize silage quality. 展开更多
关键词 Meta-QTL Silage quality Maize GWAS Candidate genes
暂未订购 下载PDF
基于元分析和生物信息学分析的玉米抗旱相关性状QTL一致性区间定位 认领 引用 被引量：14
18
作者 栗文娟 刘志斋 +4 位作者 石云素 宋燕春 王天宇 徐辰武 黎裕 《作物学报》 CAS 北大核心 2010年第9期1457-1467,共11页
定位玉米基因组中一致的抗旱性区段是玉米抗旱分子育种的重要基础。本研究对至今发表的在干旱条件下定位的相关性状QTL信息搜集整理,以IBM2 2008 Neighbors为参考图谱,利用overview分析和元分析方法进行Meta-QTL(MQTL)检测,共发掘79个MQ... 定位玉米基因组中一致的抗旱性区段是玉米抗旱分子育种的重要基础。本研究对至今发表的在干旱条件下定位的相关性状QTL信息搜集整理,以IBM2 2008 Neighbors为参考图谱,利用overview分析和元分析方法进行Meta-QTL(MQTL)检测,共发掘79个MQTL,生物信息学分析结果显示,有43个区间内包含抗旱相关基因信息,占检出MQTL总数的54.43%。基于MaizeGDB网站的Genome Browser中的遗传图谱与物理图谱的整合信息,进行MQTL物理距离的估算,根据maizesequence网站的玉米基因组序列信息,进行初步的抗旱基因预测表明,这些区段中包含丰富的MYB、bZIP以及DREB转录因子序列信息以及大量的LEA基因家族成员。 展开更多
关键词 玉米 抗旱性 “一致性”QTL 元分析 生物信息学方法
暂未订购 下载PDF
玉米穗粗性状的全基因组关联分析及QTL元分析 认领 引用 被引量：9
19
作者 邵晓宇 宋希云 +1 位作者 潘顺祥 赵美爱 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期2091-2102,共12页
玉米(Zea mays)是全世界总产量最高的粮食作物,穗粗是玉米单株产量的重要指标。利用Farm CPU软件对292份玉米自交系进行全基因组关联分析(GWAS),筛选到28个显著性单核苷酸多态性(SNP)位点。借助IBM2 2008 Neighbors高密度图谱整合了2007... 玉米(Zea mays)是全世界总产量最高的粮食作物,穗粗是玉米单株产量的重要指标。利用Farm CPU软件对292份玉米自交系进行全基因组关联分析(GWAS),筛选到28个显著性单核苷酸多态性(SNP)位点。借助IBM2 2008 Neighbors高密度图谱整合了2007~2015年文献发表的105个玉米穗粗性状的数量性状基因座(QTL),采用元分析的方法,确定了10个与穗粗相关的"一致性"QTL(Meta-QTL)。通过查询各年各点最显著的SNP位点,以及位于Meta-QTL内的显著性SNP位点,获得了9个玉米穗粗的候选基因,分别位于玉米染色体区段bin 1.10、3.09、4.08、5.05、6.07、8.03、9.05、10.04。全基因组关联分析和Meta-QTL筛选的穗粗候选基因可以为玉米分子标记辅助育种和基因克隆提供有用的信息。本研究对玉米穗粗性状的遗传改良及高产稳产育种提供参考。 展开更多
关键词 玉米 穗粗 全基因组关联分析 元分析
暂未订购 下载PDF
基于元分析的大豆胞囊线虫抗性QTL的整合 认领 引用 被引量：8
20
作者 张闻博 蒋洪蔚 +7 位作者 李灿东 邱鹏程 齐照明 刘春燕 姜威 王晶 胡国华 陈庆山 《中国油料作物学报》 CAS 北大核心 2010年第1期104-109,共6页
以2004年发布的大豆公共遗传图谱soymap2为参考图谱,共搜集整理了自1994年以来已报道的与抗大豆胞囊线虫相关的151个QTLs,通过BioMercator2.1和公共标记将相关QTLs映射整合到大豆公共遗传连锁图谱soymap2上,并利用元分析技术发掘"... 以2004年发布的大豆公共遗传图谱soymap2为参考图谱,共搜集整理了自1994年以来已报道的与抗大豆胞囊线虫相关的151个QTLs,通过BioMercator2.1和公共标记将相关QTLs映射整合到大豆公共遗传连锁图谱soymap2上,并利用元分析技术发掘"真实"QTL。本文共发掘出与抗大豆胞囊线虫1、2、3、4、5和14号生理小种相关的16个"真实"QTL,其中有四个位点的图距小于1.5cM,一个位点的图距小于5cM,分布于A2、E和G连锁群,其中G连锁群上5.11cM处的定位区间包含已报道的Rhg1位点;发现在G连锁群上有一个定位区间控制1,4号生理小种,在B1连锁群上有一个定位区间控制2,5号生理小种,可见这些位点具有兼抗性。 展开更多
关键词 大豆胞囊线虫 QTL的映射 元分析 真实QTL
暂未订购 下载PDF
已选0条
引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
上一页 1 2 3 下一页 到第 页
在线咨询 使用帮助 返回顶部 意见反馈