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The basic helix-loop-helix(bHLH)gene family in Clinacanthus nutans:insights into tissue-specific expression,stress responses,and methyl jasmonate(MeJA)responsiveness 认领 引用
1
作者 Chang An Denghang Wu +6 位作者 Ningwei Li Yixin Yao Lin Lu Yan Cheng Zongshen Zhang Ping Zheng Yuan Qin 《Medicinal Plant Biology》 2025年第1期96-109,共14页
Clinacanthus nutans is valued for its medicinal properties,largely attributed to bioactive compounds such as flavonoids,polyphenols,and other secondary metabolites.These compounds accumulate differentially across tiss... Clinacanthus nutans is valued for its medicinal properties,largely attributed to bioactive compounds such as flavonoids,polyphenols,and other secondary metabolites.These compounds accumulate differentially across tissues and are influenced by environmental cues and phytohormones like methyl jasmonate(MeJA).Transcription factors play pivotal roles in mediating these responses,with the basic helix-loop-helix(bHLH)gene family emerging as key regulators of hormone-and stress-responsive gene expression involved in secondary metabolism.In this study,182 bHLHs were identified in C.nutans,labeled CnbHLH001 to CnbHLH182 according to their chromosomal locations.Phylogenetic analysis grouped them into 26 subfamilies,with 10 classified as orphans.Structural characterization revealed subfamily-specific motif architectures and exon–intron structures.Gene duplication analysis indicated that segmental duplication was a major driver of CnbHLH family expansion,and expression analysis suggested both conserved and divergent expression among duplicated gene pairs.Tandemly duplicated genes such as CnbHLH044 to CnbHLH047 showed similar expression patterns.Synteny analysis showed that CnbHLHs in Acanthaceae species are more similar to each other than to genes in other species,suggesting a possible Acanthaceae-specific expansion.Furthermore,this study provides the first genome-wide analysis of CnbHLHs expression in response to abiotic stresses.Many CnbHLHs showed tissuespecific expression and responded differentially to MeJA and stress treatments.These findings provide a foundation for future research to explore the regulatory mechanisms of CnbHLHs and their potential to improve the medicinal properties of C.nutans. 展开更多
关键词 environmental cues stress responses secondary metabolitesthese tissue specific expression clinacanthus nutans bioactive compounds methyl jasmonate meja transcription factors basic helix loop helix genes
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High-throughput sequencing of highbush blueberry transcriptome and analysis of basic helix-loop-helix transcription factors 认领 引用 被引量：8
2
作者 SONG Yang LIU Hong-di +5 位作者 ZHOU Qiang ZHANG Hong-jun ZHANG Zhi-dong LI Ya-dong WANG Hai-bo LIU Feng-zhi 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2017年第3期591-604,共14页
The highbush blueberry（Vaccinium corymbosum）,Duke,was used to construct a de novo transcriptome sequence library and to perform data statistical analysis.Mega 4,CLC Sequence Viewer 6 software,and quantitative PCR we... The highbush blueberry（Vaccinium corymbosum）,Duke,was used to construct a de novo transcriptome sequence library and to perform data statistical analysis.Mega 4,CLC Sequence Viewer 6 software,and quantitative PCR were employed for bioinformatics and expression analyses of the basic helix-loop-helix（BHLH）transcription factors of the sequencing library.The results showed that 28.38 gigabytes of valid data were obtained from transcriptome sequencing and were assembled into 108 033 unigenes.Functional annotation showed that 32 244 unigenes were annotated into Clusters of Orthologous Groups（COG）and Gene Ontology（GO）databases,whereas the rest of the 75 789 unigenes had no matching information.By using COG and GO classification tools,sequences with annotation information were divided into 25 and 52 categories,respectively,which involved transport and metabolism,transcriptional regulation,and signal transduction.Analysis of the transcriptome library identified a total of 59 BHLH genes.Sequence analysis revealed that 55 genes of that contained a complete BHLH domain.Furthermore,phylogenetic analysis showed that BHLH genes of blueberry（Duke）could be divided into 13 sub-groups.PCR results showed that 45 genes were expressed at various developmental stages of buds,stems,leaves,flowers,and fruits,suggesting that the function of BHLH was associated with the development of different tissues and organs of blueberry,Duke.The present study would provided a foundation for further investigations on the classification and functions of the blueberry BHLH family. 展开更多
关键词 blueberry bioinformatics transcdptome sequencing basic helix-loop-helix transcription factor
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PsPRE1 is a basic helix-loop-helix transcription factor that confers enhanced root growth and tolerance to salt stress in poplar 认领 引用 被引量：3
3
作者 Jiujun Du Xiaolan Ge +4 位作者 Hantian Wei Min Zhang Yongxia Bai Lei Zhang Jianjun Hu 《Forestry Research》 2023年第1期149-157,共9页
The basic helix-loop-helix(bHLH)family of transcription factors is one of the largest and oldest transcription factor families in plants.Members of the bHLH family regulate various growth and metabolic processes in pl... The basic helix-loop-helix(bHLH)family of transcription factors is one of the largest and oldest transcription factor families in plants.Members of the bHLH family regulate various growth and metabolic processes in plants.We used quantitative trait locus(QTL)mapping and transcriptome sequencing(RNA-seq)to identify PRE1 as a candidate bHLH transcription factor associated with root dry weight(RDW)in poplar.PRE1 was highly expressed in the roots and xylem,and was responsive to gibberellin,salicylic acid,drought,and salt stress.We cloned the PRE1 homolog from Populus simonii'Tongliao1',referred to as PsPRE1,and transformed it into 84K poplar(Populus alba×Populus glandulosa).The overexpression of PsPRE1 in 84K poplar increased adventitious root development,fresh weight,total root number,and maximum root length.Poplar lines overexpressing PsPRE1 also exhibited enhanced salt tolerance while retaining a normal growth phenotype in the presence of salt stress.Catalase(CAT)activity in the PsPRE1 overexpression lines was higher than that of the wild-type,which may play a role in detoxifying stress-induced hydrogen peroxide production.An RNA-seq analysis of the PsPRE1 overexpression line revealed several differentially expressed genes(DEGs)involved in or related to auxin-,gibberellin-,and salicylic acid pathways,which indicates that the regulation of root development in poplar by PsPRE1 may involve multiple hormones. 展开更多
关键词 bhlh transcription factor transcription factor basic helix loop helix growth metabolic processes quantitative trait locus qtl mapping transcriptome sequencing rna seq root growth
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再生障碍性贫血诊断标志物微小RNA-144和微小RNA-451:靶向BHLHE41的机制研究 认领 引用
4
作者 陈丹丹 黄欣瑜 +5 位作者 耿雪银 凌玲 施青青 王勇 谢晓艳 王方方 《实用临床医药杂志》 CAS 2026年第6期111-118,共8页
目的探讨再生障碍性贫血(AA)患者外周血微小RNA(miR)-144、miR-451的表达情况及临床意义。方法收集2016年10月—2023年12月扬州大学附属苏北人民医院血液科收治的35例AA患者外周血样本。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测miR-144、miR-... 目的探讨再生障碍性贫血(AA)患者外周血微小RNA(miR)-144、miR-451的表达情况及临床意义。方法收集2016年10月—2023年12月扬州大学附属苏北人民医院血液科收治的35例AA患者外周血样本。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测miR-144、miR-451的表达水平;采用Spearman相关性分析探讨miR-144、miR-451表达水平与实验室指标的相关性;采用Logistic回归模型分析AA患者疾病严重程度的危险因素以及miR-144、miR-451对AA的诊断价值;采用Cox回归分析探讨AA患者死亡的影响因素;采用生物信息学分析筛选AA差异性基因;采用qRT-PCR检测AA患者骨髓单个核细胞基本螺旋-环-螺旋家族成员e41(BHLHE41)表达水平。结果35例AA患者中,重型再生障碍性贫血(SAA)患者17例,非重型再生障碍性贫血(NSAA)患者18例。SAA组患者白细胞(WBC)、中性粒细胞(N)、淋巴细胞(L)、血小板(PLT)较NSAA组患者降低,差异有统计学意义(P0.05)。miR-451相对表达水平与红细胞分布宽度变异系数(RDW-CV)呈显著正相关(r=0.578,P=0.001),与血清铁(SI)呈显著负相关(r=-0.456,P=0.038)。单因素分析显示,疾病严重程度、RDW-CV与AA死亡有相关性(SAA∶NSAA,Log-rankχ2=7.658,P=0.006;RDW-CV≥14.8%∶RDW-CV0.05)。差异基因分析筛选出BHLHE41是上调基因之一。AA患者骨髓单个核细胞中BHLHE41表达水平较对照组升高,但差异无统计学意义(P>0.05)。结论AA患者miR-144、miR-451水平降低,miR-144可能通过靶向BHLHE41调控细胞分化参与AA的发病。 展开更多
关键词 再生障碍性贫血 微小RNA-144 微小RNA-451 基本螺旋-环-螺旋家族成员e41 生物标志物 差异表达基因 红细胞分布宽度变异系数 血清铁
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基础化学实验中基本操作教学的探索与实践 认领 引用
5
作者 丁琼 刘海燕 +4 位作者 刘欲文 谢敏 杨鹰 吴晓军 胡锴 《大学化学》 CAS 2026年第6期160-165,共6页
基本操作教学是化学实验教学的重要组成部分。本文介绍了武汉大学基础化学实验教学组在基本操作教学领域的探索与实践。构建了五步闭环教学模式,在开展技能培训的同时注重培养思维能力,使教学过程由“单向推进”转变为“循环优化”,为... 基本操作教学是化学实验教学的重要组成部分。本文介绍了武汉大学基础化学实验教学组在基本操作教学领域的探索与实践。构建了五步闭环教学模式,在开展技能培训的同时注重培养思维能力,使教学过程由“单向推进”转变为“循环优化”,为教学效果的稳定提升提供了关键保障。 展开更多
关键词 基础化学实验 基本操作 五步闭环教学模式 实操考核
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BHLHE40在炎症和纤维化中的作用研究进展 认领 引用
6
作者 韩迪 霍银萍 朱凌妍 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2026年第5期1255-1259,共5页
碱性螺旋-环-螺旋家族成员E40(BHLHE40)是一种在多种细胞中均有表达的转录因子,在细胞凋亡、内皮生长、炎症和纤维化等生物过程中发挥关键作用。BHLHE40在免疫细胞分化、激活、炎症微环境及纤维化发生发展中扮演重要角色,本文从BHLHE40... 碱性螺旋-环-螺旋家族成员E40(BHLHE40)是一种在多种细胞中均有表达的转录因子,在细胞凋亡、内皮生长、炎症和纤维化等生物过程中发挥关键作用。BHLHE40在免疫细胞分化、激活、炎症微环境及纤维化发生发展中扮演重要角色,本文从BHLHE40的结构及功能着手,重点介绍BHLHE40通过调控免疫细胞功能以及促进上皮-间充质转化等途径,参与组织和器官炎症和纤维化发生发展,以期探讨其潜在的临床应用价值。 展开更多
关键词 碱性螺旋-环-螺旋家族成员E40 炎症 纤维化
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急性脑梗死患者血清BHLHE40、SERPINE1、BLVRB水平与其颈动脉粥样硬化程度、近期预后的关系 认领 引用
7
作者 宋媛媛 暴茜茜 +1 位作者 郝爱景 闫洪娟 《中风与神经疾病杂志》 CAS 2026年第3期227-231,共5页
目的探究急性脑梗死(ACI)患者血清碱性螺旋-环-螺旋转录因子40(BHLHE40)、丝氨酸蛋白酶抑制剂家族E成员1(SERPINE1)、胆绿素还原酶B(BLVRB)水平与其颈动脉粥样硬化(CAS)程度、近期预后的关系。方法选择2023年4月—2024年8月邯郸市第一医... 目的探究急性脑梗死(ACI)患者血清碱性螺旋-环-螺旋转录因子40(BHLHE40)、丝氨酸蛋白酶抑制剂家族E成员1(SERPINE1)、胆绿素还原酶B(BLVRB)水平与其颈动脉粥样硬化(CAS)程度、近期预后的关系。方法选择2023年4月—2024年8月邯郸市第一医院(以下简称“本院”)收治的112例ACI患者(研究组),另选取在本院通过健康体检的110例健康人为对照组。根据患者颈动脉内膜中层的厚度(IMT)结果,将研究组患者中的22例纳入正常组,38例纳入增厚组,52例纳入斑块组。以预后评估结果为基准,将研究组患者中的68例纳入预后良好组,44例纳入预后不良组。用ELISA法测定BHLHE40、SERPINE1、BLVRB在ACI患者血清中的表达水平;多因素Logistic回归分析ACI预后不良危险因素;ROC曲线分析BHLHE40、SERPINE1、BLVRB的预测价值。结果与对照组比较,研究组患者血清BHLHE40、SERPINE1、BLVRB水平明显升高(P<0.05);与正常组对比,增厚组、斑块组患者血清BHLHE40、SERPINE1、BLVRB水平明显升高,且斑块组显著高于增厚组(P<0.05);与预后良好组比较,预后不良组血清BHLHE40、SERPINE1、BLVRB水平及NIHSS评分明显提高(P<0.05);在ACI患者中,血清BHLHE40、SERPINE1、BLVRB水平升高,NIHSS评分提高是其预后不良的危险因素(P<0.05);BHLHE40、SERPINE1、BLVRB联用,预测ACI预后不良的AUC为0.939;联合预测AUC优于单独预测(Z值分别为3.804、3.197、3.240,P<0.05)。结论ACI患者血清BHLHE40、SERPINE1、BLVRB水平升高,三者不仅与病情进展相关,亦是预后的影响因素;联合检测可有效提升对ACI不良预后的预测效能。 展开更多
关键词 碱性螺旋-环-螺旋转录因子40 丝氨酸蛋白酶抑制剂家族E成员1 胆绿素还原酶B 急性脑梗死 颈动脉粥样硬化
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ON INVERSES AND ALGEBRAIC LOOPS OF CO-H-SPACES 认领 引用
8
作者 Dae-Woong LEE 《Acta Mathematica Scientia》 SCIE CSCD 2014年第4期1193-1211,共19页
In this paper we study the properties of homotopy inverses of comultiplications and Mgebraic loops of co-H-spaces based on a wedge of spheres. We also investigate a method to construct new comultiplications out of old... In this paper we study the properties of homotopy inverses of comultiplications and Mgebraic loops of co-H-spaces based on a wedge of spheres. We also investigate a method to construct new comultiplications out of old ones by using a group action. We are primarily interested in the algebraic loops which have inversive, power-associative and Moufang properties for some comultiplications. 展开更多
关键词 inverses co-H-spaces comultiplications basic （Whitehead） product Hopf- Hilton invariants algebraic loops inversivity power-associativity Moufang property
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樟树bHLH基因家族鉴定及其在两个化学型中的表达分析 认领 引用 被引量：1
9
作者 周生财 林仕雄 +3 位作者 宋敏燕 胡现铬 童再康 张俊红 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2025年第9期2948-2959,共12页
植物碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)作为植物第二大类转录因子,广泛参与其生长发育、次生代谢合成调控等。本研究旨在全基因组范围内鉴定樟树(Cinnamomum camphora)bHLH转录因子,并研究其在两个化学型中的表达模式。本... 植物碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)作为植物第二大类转录因子,广泛参与其生长发育、次生代谢合成调控等。本研究旨在全基因组范围内鉴定樟树(Cinnamomum camphora)bHLH转录因子,并研究其在两个化学型中的表达模式。本研究在全基因组范围内鉴定樟树bHLH家族成员,运用生物信息学分析其蛋白质理化性质、保守基序(motif)和系统进化等,基于樟树两个化学型(脑樟和芳樟)转录组数据分析bHLH成员的表达模式,并运用RT-qPCR进行验证。在樟树中鉴定出148个bHLH成员,大部分bHLH蛋白质分子富含酸性氨基酸且为亲水蛋白质;可分为24个亚家族,保守基序中motif 1和motif 2出现频率最高;转录组数据表明,27个bHLH基因在脑樟叶片中显著上调表达,分布于13个樟树bHLH亚家族,并用定量PCR验证了6个bHLH成员在两个化学型中的表达模式。本研究结果为进一步揭示樟树bHLH转录因子调控萜类物质的合成提供了参考依据。 展开更多
关键词 樟树 bHLH基因家族 萜类物质 化学型
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血清AEP、CTRP4、BHLHE40与2型糖尿病患者糖脂代谢及颈动脉粥样硬化的关系 认领 引用 被引量：1
10
作者 胡艳艳 雷庆华 +4 位作者 王闪闪 王志娟 李军华 马晓云 李霞 《检验医学与临床》 CAS 2025年第16期2171-2176,共6页
目的分析2型糖尿病(T2DM)患者血清天冬酰胺内肽酶(AEP)、补体C1q/肿瘤坏死因子相关蛋白4(CTRP4)、碱性螺旋-环-螺旋转录因子40(BHLHE40)与糖脂代谢及颈动脉粥样硬化(CAS)的关系。方法选择2022年2月至2023年12月于该院门诊就诊的T2DM患者... 目的分析2型糖尿病(T2DM)患者血清天冬酰胺内肽酶(AEP)、补体C1q/肿瘤坏死因子相关蛋白4(CTRP4)、碱性螺旋-环-螺旋转录因子40(BHLHE40)与糖脂代谢及颈动脉粥样硬化(CAS)的关系。方法选择2022年2月至2023年12月于该院门诊就诊的T2DM患者210例作为T2DM组,另外选取同期在该院体检的体检健康者100例作为对照组。根据有无CAS将T2DM患者分为单纯T2DM组和CAS组。检测所有研究对象血清AEP、CTRP4、BHLHE40及糖脂代谢指标水平。采用Pearson相关分析T2DM患者血清AEP、CTRP4、BHLHE40水平与糖脂代谢指标的相关性;采用多因素Logistic回归分析T2DM患者发生CAS的影响因素。结果T2DM组的空腹血糖(FPG)、糖化血红蛋白(HbA1c)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)及血清AEP、BHLHE40水平均高于对照组(P<0.05),CTRP4水平低于对照组(P<0.05)。T2DM患者血清AEP、BHLHE40水平与FPG、HbA1c、TG、LDL-C水平及HOMA-IR均呈正相关(P<0.05),CTRP4水平与FPG、HbA1c、TG、LDL-C水平及HOMA-IR均呈负相关(P<0.05)。210例T2DM患者中发生CAS 138例(CAS组),单纯T2DM组72例。CAS组年龄、糖尿病病程、收缩压、HbA1c、LDL-C及血清AEP、BHLHE40水平均高于单纯T2DM组(P<0.05),CTRP4水平则低于单纯T2DM组(P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,LDL-C、AEP、BHLHE40水平升高均是T2DM患者发生CAS的危险因素(P<0.05),CTRP4水平升高是T2DM患者发生CAS的保护因素(P<0.05)。结论T2DM患者血清AEP、BHLHE40水平升高,CTRP4水平降低,三者与T2DM患者的糖脂代谢关系密切,且是T2DM患者发生CAS的影响因素。 展开更多
关键词 2型糖尿病 糖脂代谢 胰岛素抵抗 颈动脉粥样硬化 天冬酰胺内肽酶 补体C1q/肿瘤坏死因子相关蛋白4 碱性螺旋-环-螺旋转录因子40
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基本螺旋-环-螺旋家族成员E40在免疫细胞中的研究进展 认领 引用
11
作者 罗镇颉 张登容 +3 位作者 刘春瑶 高玲 龙仙萍 汪松 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2025年第6期1512-1516,共5页
免疫细胞由骨髓里的造血干细胞增殖分化形成,包括淋巴细胞、巨噬细胞和中性粒细胞等,它们参与了机体的免疫防御、免疫稳定和免疫监视,是免疫系统不可或缺的基本成分。基本螺旋-环-螺旋家族成员E40(basic helix-loop-helix E40,BHLHE40)... 免疫细胞由骨髓里的造血干细胞增殖分化形成,包括淋巴细胞、巨噬细胞和中性粒细胞等,它们参与了机体的免疫防御、免疫稳定和免疫监视,是免疫系统不可或缺的基本成分。基本螺旋-环-螺旋家族成员E40(basic helix-loop-helix E40,BHLHE40)已被证实在脂肪生成、肿瘤发生、昼夜节律和缺氧反应等过程中发挥重要作用。近年研究发现,BHLHE40在免疫细胞活化、细胞周期、自我更新和细胞因子产生等方面也扮演着重要角色。本文将对BHLHE40在各个时期的发现、命名、结构和作用机制,以及在免疫细胞中的研究进展等进行综述,以期在基因层面为免疫相关性疾病的治疗提供新靶点。 展开更多
关键词 基本螺旋-环-螺旋家族成员E40 免疫细胞活化 细胞周期 自我更新 细胞因子
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计算机基础课程“四位一体”教学模式改革与实践 认领 引用 被引量：2
12
作者 唐贤芳 仲崇丽 段林 《办公自动化》 2025年第6期28-30,共3页
针对计算机基础课程实践过程中面临的问题,基于OBE理念,秉承“德育为先、学生中心、持续优化”的教育思想,坚持能力素质为导向,提出“四位一体”教学闭环模式的改革与创新。聚焦四位,从教学内容、实践活动,延拓学习及赛教融合等多角度... 针对计算机基础课程实践过程中面临的问题,基于OBE理念,秉承“德育为先、学生中心、持续优化”的教育思想,坚持能力素质为导向,提出“四位一体”教学闭环模式的改革与创新。聚焦四位,从教学内容、实践活动,延拓学习及赛教融合等多角度进行改革,不断持续改进和优化,培养出学生利用计算机分析和解决问题的综合能力和素养,实现知识传授、能力培养与价值塑造的人才培养目标,为计算机类相关课程的改革提供有益借鉴。 展开更多
关键词 计算机基础课程 四位一体 教学闭环
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bHLH47对番茄果实茉莉酸合成的调控机制 认领 引用
13
作者 师瑞茜 常枭荣 +2 位作者 余金兰 孙丹丹 路来风 《食品科学技术学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2025年第4期128-137,共10页
作为植物抵御灰霉菌等腐生性致病菌的主要调控物质之一,茉莉酸在番茄果实成熟过程中的变化规律及其调控机制尚不清楚。因此,采用酶联免疫吸附实验测定不同成熟期番茄果实表皮组织中的茉莉酸含量,结合实时荧光定量PCR分析茉莉酸关键合成... 作为植物抵御灰霉菌等腐生性致病菌的主要调控物质之一,茉莉酸在番茄果实成熟过程中的变化规律及其调控机制尚不清楚。因此,采用酶联免疫吸附实验测定不同成熟期番茄果实表皮组织中的茉莉酸含量,结合实时荧光定量PCR分析茉莉酸关键合成基因13-脂氧化酶(LOXD)、12-氧-植物二烯酸还原酶3(OPR3)和丙二烯氧化物合酶(AOS)等的表达量。以成熟与抗病双响应转录因子碱性螺旋-环-螺旋蛋白编码基因47(bHLH47)作为研究对象,通过病毒诱导的基因沉默技术研究bHLH47对番茄果实茉莉酸合成的调控作用。结果表明,绿熟期番茄果实中的茉莉酸浓度最高,为1.63 nmol/L;而红熟期果实中的茉莉酸浓度最低,为1.28 nmol/L。与小果期果实相比,红熟期果实中OPR3基因表达显著下调,降低了89.38%,表明茉莉酸合成受番茄果实成熟度的影响。在bHLH47基因沉默的番茄果实中,茉莉酸浓度增加了24.44%,OPR3基因的表达量相比对照组提高了2.3倍,12-氧-植物二烯酸还原酶(OPR)浓度增加了10.61%。研究表明,转录因子bHLH47通过负调控OPR3基因的表达来调控茉莉酸的合成,从而影响成熟过程中番茄果实对灰霉菌的抵抗能力。研究旨在阐明番茄果实成熟过程中灰霉菌易感性增加的茉莉合成的调控机制,为番茄采后腐烂损失控制提供理论参考。 展开更多
关键词 茉莉酸 碱性螺旋-环-螺旋蛋白编码基因47 病毒诱导的基因沉默 番茄 转录调控
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向日葵bHLH转录因子家族的鉴定及逆境应答基因筛选 认领 引用
14
作者 高宇 付畅 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2025年第8期2474-2489,共16页
向日葵(Helianthus annuus L.)对盐碱有较强的耐性,是世界上重要的经济作物,碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子是参与真核生物生长发育以及逆境应答的重要调控因子。本研究利用生物信息学方法对向日葵中bHLH转录... 向日葵(Helianthus annuus L.)对盐碱有较强的耐性,是世界上重要的经济作物,碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子是参与真核生物生长发育以及逆境应答的重要调控因子。本研究利用生物信息学方法对向日葵中bHLH转录因子家族进行了全基因组鉴定与分析,共鉴定出139个HabHLH基因,系统分析了向日葵中bHLH转录因子家族成员的分类、基本理化性质、进化关系、基因结构、染色体定位、保守基序、启动子元件、蛋白质互作、基因共线性及表达模式,筛选了逆境应答HabHLHs基因。促进了对向日葵中bHLH家族基因的多样性和进化上的认识,为探索向日葵bHLH转录因子家族成员的功能和在抗逆分子育种中的应用提供了重要的参考信息。 展开更多
关键词 向日葵 碱性螺旋-环-螺旋转录因子 鉴定 抗逆 筛选
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bHLH转录因子调控植物活性成分生物合成的研究进展 认领 引用 被引量：26
15
作者 张鑫 宋经元 +5 位作者 胡鸢雷 徐江 徐志超 季爱加 罗红梅 陈士林 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期435-442,共8页
转录因子是在转录水平上调控基因表达的关键因素之一,在植物生长发育、活性成分合成和环境变化响应中起着重要作用。本文对植物中bHLH转录因子的结构和分类进行了概述,并详细阐述了bHLH转录因子调控植物中类黄酮、生物碱、萜类等活性成... 转录因子是在转录水平上调控基因表达的关键因素之一,在植物生长发育、活性成分合成和环境变化响应中起着重要作用。本文对植物中bHLH转录因子的结构和分类进行了概述,并详细阐述了bHLH转录因子调控植物中类黄酮、生物碱、萜类等活性成分生物合成的研究进展,探索利用bHLH转录因子提高药用植物有效物质的生物学基础。文章强调模式植物的参考作用,突出现代基因组学、转录组学、代谢组学和生物信息学等多学科理论的交叉与融合对bHLH转录因子发掘和准确功能鉴定的促进作用。加速研究bHLH转录因子调控活性成分生物合成机制,对促进中药材育种和品种改良技术的发展,缓解国内外中草药资源枯竭的境况具有重要意义。 展开更多
关键词 bHLH 转录因子 活性成分 药用植物
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Expression of a novel bHLH-Zip gene in human testis 认领 引用 被引量：7
16
作者 Jia-HaoSHA Zuo-MinZHOU +7 位作者 Jian-MinLI MingLIN: HuiZHU HuZHU Ya-DongZHOU Li-LongWANG Yi-QuanWAIG Kai-YaZHOU 《Asian Journal of Andrology》 SCIE CAS 2003年第2期83-88,共6页
Aim: To identify specifically expressed genes in the adult and fetal testes. Methods: A human testis cDNA microarray was established. Then the mRNA of adult and fetal testis was purified and probes were prepared by a ... Aim: To identify specifically expressed genes in the adult and fetal testes. Methods: A human testis cDNA microarray was established. Then the mRNA of adult and fetal testis was purified and probes were prepared by a reverse transcription reaction with the testis mRNA as template. The microarray was hybridized with probes of adult and fetal testes. The nucleic sequences of differentially expressed genes were determined and homologies were searched in the databases of the GenBank. Results: When hybridized with adult or fetal testis probes, the positive clones were 96.8 % and 95.4 %, respectively. Among these genes, one was a new testis-specific gene, which was named TSP1. TSP1 was highly expressed in human adult testis. The cDNA of TSP1 was 1,484 bp in length. The cDNA sequence of this clone was deposited in the Genbank (AF333098). TSP1 was also determined as Interim Gen Symbol (Unigene, No. Hs.98266). Protein analysis showed that TSP1 contained two functional domains: an N-terminal basic helix-loop-helix (bHLH) and a C-terminal leucine zipper (Zip). Homologous analysis showed that the 430 amino acid sequences deduced from the 1,293 bp open reading frame (ORF) had a homology with the human gene FLJ2509 (AK098575). TSP1 had also a sequence homology with Spz 1 protein of mouse. Expression profiles showed that TSP1 was specifically and strongly expressed in the testis. Conclusion: TSP1 is a gene highly expressed in adult testis. It may play an important role in spermatogenesis in the humans. 展开更多
关键词 basic helix-loop-helix leucine zipper testis spermatogenesis DNA microarrays
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基于基本回路修正的AHP一致性调整方法研究 认领 引用 被引量：9
17
作者 解江 吴诗辉 《运筹与管理》 CSSCI CSCD 北大核心 2020年第4期147-157,共11页
为解决AHP一致性问题,提出一种基于基本回路修正的调整方法,能够同时解决数值不一致和逻辑不一致问题,同时保证对原始信息的修改量最小。数值不一致和逻辑不一致均由决策者的不准确判断引起,其中数值不一致可以通过降低一致性比率(CR)... 为解决AHP一致性问题,提出一种基于基本回路修正的调整方法,能够同时解决数值不一致和逻辑不一致问题,同时保证对原始信息的修改量最小。数值不一致和逻辑不一致均由决策者的不准确判断引起,其中数值不一致可以通过降低一致性比率(CR)值进行改善,而逻辑不一致只有将判断矩阵中所有三阶回路去除才能得到解决。因此,通过对n阶判断矩阵进行基本矩阵分解,得到Cn^3个3阶的基本矩阵,其中存在三阶回路的称为基本回路,从而将判断矩阵的一致性修正问题转化为基本回路的一致性修正问题。通过对基本回路的一致性比较,提出了两种确定最不一致元素的方法,即CR和最大法和优化法,并设计了优化模型对最不一致元素进行修正。最后,通过算例分析验证了本文方法的可行性,与已有方法的对比结论证明了本文方法更为有效。 展开更多
关键词 层次分析法 基本回路 逻辑一致性 数值一致性 一致性比率
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纬编针织物基本组织的计算机三维模拟 认领 引用 被引量：14
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作者 瞿畅 王君泽 李波 《纺织学报》 CAS 北大核心 2009年第11期136-140,共5页
针对当前针织物模拟技术存在的缺陷及不足,探索计算机模拟纬编针织物的新方法。在Visual Basic环境下,以Pierce模型为基础,采用圆形截面,由三次B样条曲线模拟纱线路径,利用虚拟现实建模语言(VRML)实现纬编针织物线圈及基本组织的计算机... 针对当前针织物模拟技术存在的缺陷及不足,探索计算机模拟纬编针织物的新方法。在Visual Basic环境下,以Pierce模型为基础,采用圆形截面,由三次B样条曲线模拟纱线路径,利用虚拟现实建模语言(VRML)实现纬编针织物线圈及基本组织的计算机三维模拟。模拟结果很好地表现了针织组织在空间的串套关系以及整体效果,可通过网络浏览器直接进行浏览;模拟图像便于网络发布,并可动态对其进行任意的平移、缩放、旋转等操作。 展开更多
关键词 纬编针织物 基本组织 线圈模型 三维模拟 虚拟现实建模语言
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家蚕bHLH转录因子Bmsage可溶性表达、纯化与结构分析 认领 引用 被引量：3
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作者 何华伟 位曙光 +5 位作者 王叶菁 刘莉娜 李珍珍 赵朋 常怀普 赵萍 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1395-1407,共13页
碱性螺旋-环-螺旋(Basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子在生命活动过程中发挥着重要的调控作用。Bmsage是家蚕丝腺中高量表达的一类bHLH转录因子,不仅参与了丝腺细胞在胚胎期的发育调控,而且对蚕丝蛋白的合成也有至关重要的调控作用,... 碱性螺旋-环-螺旋(Basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子在生命活动过程中发挥着重要的调控作用。Bmsage是家蚕丝腺中高量表达的一类bHLH转录因子,不仅参与了丝腺细胞在胚胎期的发育调控,而且对蚕丝蛋白的合成也有至关重要的调控作用,然而当前对其性质和结构了解不多。为研究其性质、结构和生物学功能,构建了NusA、MBP、SUMO、Trx和His融合标签的Bmsage重组原核表达载体,通过改变诱导温度和IPTG浓度,确定了Bmsage在大肠杆菌中可溶性表达的最佳载体和表达条件,进而通过镍柱亲和层析纯化获得了Bmsage,利用圆二色光谱研究了其二级结构。结果表明,NusA与MBP标签可显著增强Bmsage在大肠杆菌中的可溶性表达,但难以与Bmsage分离。SUMO标签有一定的助溶效果,并且能够与Bmsage有效分离。其他标签对Bmsage可溶性表达的效果不明显。圆二色光谱分析表明Bmsage含有α-helix结构,推测SUMO标签可能促进了Bmsage折叠形成类天然的结构。这些工作为深入研究Bmsage的性质、结构与功能建立了基础,同时也为其他类似蛋白的表达纯化提供了参考。 展开更多
关键词 碱性螺旋-环-螺旋 Bmsage MBP NusA SUMO 纯化
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绿豆bHLH转录因子家族的鉴定与生物信息学分析 认领 引用 被引量：18
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作者 陈红霖 胡亮亮 +2 位作者 王丽侠 王素华 程须珍 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期1159-1167,共9页
bHLH是真核生物中重要的一类转录因子,其主要由碱性氨基酸区和螺旋-环-螺旋区组成。本研究利用生物信息学的方法鉴定到122个绿豆bHLH转录因子,并对其理化性质、保守结构域、基因结构、在染色体上的分布、系统进化以及部分典型基因的组... bHLH是真核生物中重要的一类转录因子,其主要由碱性氨基酸区和螺旋-环-螺旋区组成。本研究利用生物信息学的方法鉴定到122个绿豆bHLH转录因子,并对其理化性质、保守结构域、基因结构、在染色体上的分布、系统进化以及部分典型基因的组织表达差异等进行分析。结果表明,bHLH转录因子理化性质差异较大;含有2个保守结构域,分别位于N端的碱性氨基酸区和C端的螺旋-环-螺旋区,碱性氨基酸区含有His5-Glu9-Arg13保守序列,与靶基因结合有关,HLH区含有Arg23和Arg55,与形成二聚体有关,同时含有5种保守元件;bHLH基因在11条染色体上分布不均匀,5号、7号和8号染色体上分布较多,1号、4号和10号染色体上分布较少,大部分基因含有1~9个不等的内含子,在染色体上成簇状分布;122个bHLH转录因子可分为11个亚家族。多数bHLH基因在绿豆根、茎、叶、花和种子等组织中均有表达,但具有组织表达特异性,且不同基因表达量差异较大。本研究为进一步研究绿豆bHLH转录因子家族的生物学功能奠定基础。 展开更多
关键词 绿豆 bHLH 转录因子 生物信息学分析
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