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Diverse functions of C2H2 zinc-finger transcription factors in growth regulation and stress adaptation in woody and perennial horticultural plants 认领 引用
1
作者 Minhui Li Chenhao Zhu +6 位作者 Cheng Jiang Yi An Lichao Huang Ningning Chen Mengzhu Lu Fengxia Tian Jin Zhang 《Horticultural Plant Journal》 SCIE CAS CSCD 2026年第8期1793-1809,共17页
C2H2 zinc finger proteins(C2H2-ZFPs),one of the largest transcription factor families in plants,exhibit unique functional diversity in woody and horticultural species due to their modular architecture and regulatory f... C2H2 zinc finger proteins(C2H2-ZFPs),one of the largest transcription factor families in plants,exhibit unique functional diversity in woody and horticultural species due to their modular architecture and regulatory flexibility.This review synthesizes recent advances in understanding their roles in perennial growth cycles and horticultural trait regulation,with a focus on their contributions to fruit development,secondary growth,and complex environmental adaptation.Structurally,C2H2-ZFPs harbor conserved zinc-coordinating motifs(C2H2 domains)and regulatory domains,enabling precise transcriptional control of developmental processes.In woody and horticultural plants,they integrate hormonal signals(e.g.,auxin,ABA)and environmental cues(e.g.,drought,photoperiod)to regulate seasonal dormancy and flowering timing in horticultural species,cambial activity for wood formation,and fruit ripening processes.Under abiotic stress,C2H2-ZFPs act as key modulators in ABA-dependent and independent pathways,governing osmotic balance,redox homeostasis,and stress memory.Meanwhile,emerging evidence also highlights their involvement in biotic stress responses.However,dissecting their regulatory networks in woody and horticultural species remains challenging due to genomic redundancy and complex regulatory layers.Future research should leverage multi-omics approaches and CRISPR-based tools to uncover their functional redundancy and species-specific adaptations,thereby advancing sustainable forestry and precision horticulture breeding under climate change. 展开更多
关键词 Transcription factor,C2H2 zinc finger proteins Development Abiotic stress Biotic stress
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The apple C2H2-type zinc finger transcription factor MdZAT10 positively regulates JA-induced leaf senescence by interacting with MdBT2 认领 引用 被引量：13
2
作者 Kuo Yang Jian-Ping An +6 位作者 Chong-Yang Li Xue-Na Shen Ya-Jing Liu Da-Ru Wang Xing-Long Ji Yu-Jin Hao Chun-Xiang You 《Horticulture Research》 SCIE CSCD 2021年第1期2107-2120,共14页
Jasmonic acid(JA)plays an important role in regulating leaf senescence.However,the molecular mechanisms of leaf senescence in apple(Malus domestica)remain elusive.In this study,we found that MdZAT10,a C2H2-type zinc f... Jasmonic acid(JA)plays an important role in regulating leaf senescence.However,the molecular mechanisms of leaf senescence in apple(Malus domestica)remain elusive.In this study,we found that MdZAT10,a C2H2-type zinc finger transcription factor(TF)in apple,markedly accelerates leaf senescence and increases the expression of senescence-related genes.To explore how MdZAT10 promotes leaf senescence,we carried out liquid chromatography/mass spectrometry screening.We found that MdABI5 physically interacts with MdZAT10.MdABI5,an important positive regulator of leaf senescence,significantly accelerated leaf senescence in apple.MdZAT10 was found to enhance the transcriptional activity of MdABI5 for MdNYC1 and MdNYE1,thus accelerating leaf senescence.In addition,we found that MdZAT10 expression was induced by methyl jasmonate(MeJA),which accelerated JA-induced leaf senescence.We also found that the JA-responsive protein MdBT2 directly interacts with MdZAT10 and reduces its protein stability through ubiquitination and degradation,thereby delaying MdZAT10-mediated leaf senescence.Taken together,our results provide new insight into the mechanisms by which MdZAT10 positively regulates JA-induced leaf senescence in apple. 展开更多
关键词 domestica C2H2 senescence
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梅花C2H2-ZFP基因家族鉴定及低温应答模式分析 认领 引用 被引量：1
3
作者 袁重阳 郭娜娜 +3 位作者 陈可 李雪 张启翔 郑唐春 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2026年第1期46-58,67,共13页
锌指蛋白(zinc-finger protein,ZFP)作为真核生物中重要的转录因子家族,广泛参与植物逆境响应,其中C2H2型ZFP在低温胁迫中具有潜在调控功能。本研究通过生物信息学方法对梅花C2H2-ZFP基因家族进行全基因组鉴定,并分析其进化关系、基因... 锌指蛋白(zinc-finger protein,ZFP)作为真核生物中重要的转录因子家族,广泛参与植物逆境响应,其中C2H2型ZFP在低温胁迫中具有潜在调控功能。本研究通过生物信息学方法对梅花C2H2-ZFP基因家族进行全基因组鉴定,并分析其进化关系、基因结构、保守基序、染色体分布、共线性及启动子顺式作用元件,并结合转录组与qRT-PCR验证其表达模式,筛选与低温应答相关的候选基因。结果表明:梅花全基因组中鉴定出56个PmC2H2-ZFPs,不均匀分布于7条染色体;系统进化分析将其分为3个亚家族;亚细胞定位预测显示该家族成员主要定位于细胞核;启动子顺式元件分析表明PmC2H2-ZFPs含有多种激素响应元件和胁迫响应元件,其中18个成员含有低温响应元件。PmC2H2-ZFPs在梅花不同器官、不同温度处理下呈现组织特异性表达,PmZFP18在各检测组织中均有表达,而PmZFP03/11/37/44等在根中高表达,PmZFP18/49在茎中表达较高;季节动态表达分析表明PmZFP03/11/18/44在冬季表达量最高。人工低温处理下,PmZFP03/11表达变化显著,PmZFP08/16的表达随冷处理时间延长呈持续增强趋势,表明这些家族成员在梅花低温胁迫响应中起关键作用。该研究结果为深入解析梅花C2H2型ZFP家族成员在低温胁迫中的功能提供了理论基础,为梅花抗寒分子育种提供了候选基因资源。 展开更多
关键词 梅花 C2H2型ZFP 低温胁迫 基因家族分析 表达模式
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象草C2H2基因家族鉴定及表达分析 认领 引用
4
作者 杨丹 靳雅荣 +8 位作者 毛春力 王碧娴 张雅宁 杨智怡 周芷瑶 杨锐鸣 范恒睿 黄琳凯 严海东 《生物技术通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2026年第1期251-261,共11页
【目的】鉴定象草(Cenchrus purpureus)C2H2型锌指蛋白基因家族成员,探究其在低温胁迫下的调控作用,为解析C2H2转录因子的功能机制奠定基础。【方法】基于象草全基因组数据,利用生物信息学方法系统鉴定C2H2基因家族成员,结合转录组数据... 【目的】鉴定象草(Cenchrus purpureus)C2H2型锌指蛋白基因家族成员,探究其在低温胁迫下的调控作用,为解析C2H2转录因子的功能机制奠定基础。【方法】基于象草全基因组数据,利用生物信息学方法系统鉴定C2H2基因家族成员,结合转录组数据及RT-qPCR分析了象草C2H2在低温胁迫下的表达情况,并通过酿酒酵母异源表达验证关键基因功能。【结果】在象草中鉴定出144个CpC2H2基因,同时通过系统进化分析发现其可以分为10个亚组。基因结构与保守基序分析表明,同亚组成员的基因结构与保守基序呈现高度保守性;顺式作用元件分析表明,CpC2H2成员的启动子区域有65个携带低温应答相关顺式调控元件。CpC2H2基因家族的表达分析表明,该家族基因在象草中展现出显著的组织表达特异性,其中CpC2H2-33、CpC2H2-107、CpC2H2-108和CpC2H2-131在低温胁迫下显著上调,且通过酿酒酵母异源表达发现这些基因可显著增强酵母的低温耐受性。【结论】共鉴定出144个象草C2H2基因,该家族成员具有显著的组织特异性和低温胁迫表达差异性,其中CpC2H2-33/107/108/131可增强酵母的低温耐受性,暗示其可能在象草低温胁迫响应中发挥关键作用,为深入探讨C2H2家族基因的功能提供有价值的信息。 展开更多
关键词 象草 C2H2基因家族 低温胁迫 生物信息学
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植物C2H2锌指蛋白响应盐胁迫的研究进展 认领 引用
5
作者 任凡 《林业世界》 2026年第1期145-152,共8页
土壤盐渍化是影响农林业资源生产力的主要原因之一,盐胁迫主要通过引发离子危害、渗透胁迫和次生胁迫等方式,对植物的生产发育、产量、代谢等方面产生严重的迫害。在长期的自然选择过程中,植物形成了多层次的适应逆境胁迫机制,包括清除... 土壤盐渍化是影响农林业资源生产力的主要原因之一,盐胁迫主要通过引发离子危害、渗透胁迫和次生胁迫等方式,对植物的生产发育、产量、代谢等方面产生严重的迫害。在长期的自然选择过程中,植物形成了多层次的适应逆境胁迫机制,包括清除活性氧、调节信号激素、维持细胞内离子平衡、参与激素传导等。本文综述盐胁迫对植物的影响、植物对盐胁迫的响应,锌指蛋白转录因子、并着重分析有关植物C2H2锌指蛋白的耐盐方面机理和相关基因的的分子研究进展,为改善盐碱地现状和耐盐育种提供一定的参考。 展开更多
关键词 C2H2 盐胁迫 耐盐机理 分子基因 研究进展
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ZF protein C2H2-71 regulates the soluble solids content in tomato by inhibiting LIN5 认领 引用 被引量：1
6
作者 Fangman Li Junshen Lin +7 位作者 John Kojo Ahiakpa Wenxian Gai Jinbao Tao Pingfei Ge Xingyu Zhang Yizhuo Mu Jie Ye Yuyang Zhang 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2025年第6期2190-2202,共13页
oluble solids content(SSC) plays an important role in determining the flavor of tomato fruits. Tomato fruit SSC is transcriptionally regulated via sugar metabolism. Previous studies have predominantly focused on the r... oluble solids content(SSC) plays an important role in determining the flavor of tomato fruits. Tomato fruit SSC is transcriptionally regulated via sugar metabolism. Previous studies have predominantly focused on the role of C2H2-type zinc finger proteins in tomato growth and development. However, the specific regulatory mechanisms of C2H2 in the accumulation of soluble solids in tomato fruits are not fully understood. This study used eight tomato accessions with varying levels of SSC to study the expression of SlC2H2 family genes in red ripe fruits. The levels of SlC2H2-71 expression were found to be significantly reduced in high-SSC accessions compared to low-SSC accessions. Several Slc2h2-71 mutant lines were developed using the CRISPR-Cas9 system, which led to elevated levels of soluble solids, fructose, glucose, malic acid, and citric acid in mature red ripe fruits. However, the sucrose content in the edited Slc2h2-71 mutant lines was generally lower. RNA-seq analysis revealed that fruits from the mutant lines had altered expression of genes related to the sugar and acid metabolic pathways, which was further confirmed by quantitative real-time PCR. Specifically, the expression of SlLIN5 encoding the cell wall invertase(CWIN) was elevated. The yeast one-hybrid(Y1H) assay, 35S::UAS-GUS, dual-luciferase reporter systems and electrophoretic mobility shift assay(EMSA) demonstrated that C2H2-71 regulates tomato sugar metabolism by directly binding to the promoter region of Sl LIN5, culminating in the repression of its transcriptional activity. The activity of acid invertase exhibited a significantly higher level in the SlC2H2-71 knock-out lines compared to the control lines. In summary, the regulation of tomato fruit SSC by C2H2-71 involves the inhibition of SlLIN5 expression. 展开更多
关键词 Solanum lycopersicum L. C2H2 zinc finger protein transcription factor fruit flavor cell wall invertase LIN5
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Brassica napus BnaWIP2 transcription factor promotes seed germination under salinity stress by repressing ABA biosynthesis and signaling 认领 引用
7
作者 Shuangcheng He Saiqi Yang +5 位作者 Yuanchang Min Ankang Ge Junjin Liu Zijin Liu Yuan Guo Mingxun Chen 《The Crop Journal》 SCIE CAS CSCD 2025年第2期444-455,共12页
Rapeseed(Brassica napus L.)is a global oil crop.Salinity stress impedes the growth of rapeseed,especially during seed germination.The key genes mediating salinity stress response during seed germination in B.napus rem... Rapeseed(Brassica napus L.)is a global oil crop.Salinity stress impedes the growth of rapeseed,especially during seed germination.The key genes mediating salinity stress response during seed germination in B.napus remain largely unknown.Here,we found that all six paralogs of C2H2 zinc finger transcription factor WIP DOMAIN PROTEIN 2(BnaWIP2)showed increased expression during the initial 12 hours of germination,and expression was further enhanced by salinity stress.Under NaCl treatment,knocking out all six BnaWIP2 paralogs in B.napus led to significantly reduced germination,while overexpression of BnaC06.WIP2 promoted germination.Transcriptomic analysis revealed that BnaC06.WIP2 downregulated a series of genes related to abscisic acid(ABA)biosynthesis and signaling,among which BnaA05.NCED3,BnaC04.ABI5-2,BnaA03.EM6,and BnaA05.EM6 were directly repressed by BnaC06.WIP2.Further analysis showed that in germinating seeds,BnaC06.WIP2 was induced by ABA and in turn restrained ABA production,indicating that BnaC06.WIP2 forms a negative feedback loop with ABA to promote seed germination under salinity stress in B.napus.Collectively,these results enhance our understanding of the novel function of BnaWIP2 and provide valuable genetic resources for breeding salinity-tolerant rapeseed varieties. 展开更多
关键词 Rapeseed C2H2 zinc finger transcription factor Seed germination Abscisic acid Salt tolerance
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Colony-stimulating factor 3 and its receptor promote leukocyte immunoglobulin-like receptor B2 expression and ligands in gastric 认领 引用
8
作者 Long Wang Qi Wu +7 位作者 Zong-Wen Zhang Hui Zhang Hui Jin Xin-Liang Zhou Jia-Yin Liu Dan Li Yan Liu Zhi-Song Fan 《World Journal of Gastrointestinal Oncology》 SCIE 2025年第2期198-210,共13页
BACKGROUND Colony-stimulating factor 3(CSF3)and its receptor(CSF3R)are known to promote gastric cancer(GC)growth and metastasis.However,their effects on the immune microenvironment remain unclear.Our analysis indicate... BACKGROUND Colony-stimulating factor 3(CSF3)and its receptor(CSF3R)are known to promote gastric cancer(GC)growth and metastasis.However,their effects on the immune microenvironment remain unclear.Our analysis indicated a potential link between CSF3R expression and the immunosuppressive receptor leukocyte immunoglobulin-like receptor B2(LILRB2)in GC.We hypothesized that CSF3/CSF3R may regulate LILRB2 and its ligands,angiopoietin-like protein 2(ANGPTL2)and human leukocyte antigen-G(HLA-G),contributing to immunosuppression.AIM To investigate the relationship between CSF3/CSF3R and LILRB2,as well as its ligands ANGPTL2 and HLA-G,in GC.METHODS Transcriptome sequencing data from The Cancer Genome Atlas were analyzed,stratifying patients by CSF3R expression.Differentially expressed genes and immune checkpoints were evaluated.Immunohistochemistry(IHC)was performed on GC tissues.Correlation analyses of CSF3R,LILRB2,ANGPTL2,and HLA-G were conducted using The Cancer Genome Atlas data and IHC results.GC cells were treated with CSF3,and expression levels of LILRB2,ANGPTL2,and HLA-G were measured by quantitative reverse transcriptase-polymerase chain reaction and western blotting.RESULTS Among 122 upregulated genes in high CSF3R expression groups,LILRB2 showed the most significant increase.IHC results indicated high expression of LILRB2(63.0%),ANGPTL2(56.5%),and HLA-G(73.9%)in GC tissues.Strong positive correlations existed between CSF3R and LILRB2,ANGPTL2,and HLA-G mRNA levels(P0.05).CSF3 increased LILRB2,ANGPTL2,and HLA-G expression in GC cells.Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1 modulation significantly altered their expression,impacting CSF3’s regulatory effects.CONCLUSION The CSF3/CSF3R pathway may contribute to immunosuppression in GC by upregulating LILRB2 and its ligands,with heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1 playing a regulatory role. 展开更多
关键词 Gastric cancer Immunosuppressive receptor Colony-stimulating factor 3 Colony-stimulating factor 3 receptor Leukocyte immunoglobulin-like receptor B2 Angiopoietin-like protein 2 Human leukocyte antigen-G Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1
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绿豆C2H2型锌指蛋白转录因子家族鉴定及非生物胁迫下的表达分析 认领 引用
9
作者 张均 郭飞翔 +2 位作者 田文仲 李春霞 马超 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2025年第9期1875-1885,I0008-I0010,共11页
C2H2型锌指转录因子家族在植物非生物胁迫应答和生长发育等生命过程中起着重要的调控作用。为明确C2H2型锌指转录因子家族在绿豆生长发育中的功能,本研究利用绿豆(Vigna radiata L.)基因组数据和生物信息学技术鉴定了C2H2转录因子,对其... C2H2型锌指转录因子家族在植物非生物胁迫应答和生长发育等生命过程中起着重要的调控作用。为明确C2H2型锌指转录因子家族在绿豆生长发育中的功能,本研究利用绿豆(Vigna radiata L.)基因组数据和生物信息学技术鉴定了C2H2转录因子,对其理化性质、系统进化、染色体定位、共线性、启动子顺式作用元件及基因结构做了预测分析,并通过绿豆转录组数据和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析了其在不同组织与非生物胁迫下的表达模式。结果表明,共鉴定到60个C2H2转录因子成员,其中53个分布于9条染色体,7个成员染色体信息未知;Motif1和Motif3是绿豆C2H2转录因子家族所特有的保守基序,Motif3则是部分C2H2转录因子家族成员所特有的一段保守序列“QALGGH”;编码155~1 581个氨基酸,均为亲水性蛋白且均定位在细胞核中;系统进化将绿豆C2H2转录因子家族分为7个亚组(V1~V7)。共线性分析表明,片段复制事件均进行了纯化选择;启动子顺式作用元件分析表明,绿豆C2H2基因启动子区含有大量与生长发育、逆境胁迫和激素相关的响应元件;基因表达分析表明,叶柄、叶片、下胚轴、籽粒种皮中表达量较高(FPKM值大于10)的基因分别占25.0%、26.7%、20.0%、26.7%;qRT-PCR分析发现,VrC2H2-22和VrC2H2-46对于温度胁迫具有特异性的调控作用,VrC2H2-51对干旱胁迫的响应程度较强。本研究结果为进一步对绿豆C2H2锌指转录因子家族的功能研究提供了理论基础。 展开更多
关键词 绿豆 C2H2锌指蛋白转录因子 生物信息学 共线性分析 基因表达
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香蕉枯萎病菌C2H2型锌指转录因子FocFlbC的功能研究 认领 引用
10
作者 卢松茂 林秀香 +5 位作者 林亚琪 林晓兰 杨帅 郑文辉 云英子 鲁国东 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2025年第4期649-662,共14页
由香蕉枯萎病菌4号生理小种(Fusarium oxysporum f.sp.cubense tropical race 4,Foc TR4)引起的香蕉枯萎病是全球香蕉产业面临的重大土传病害,其土壤中的分生孢子和厚垣孢子是主要侵染源。构巢曲霉(Aspergillus nidulans)C2H2型锌指转... 由香蕉枯萎病菌4号生理小种(Fusarium oxysporum f.sp.cubense tropical race 4,Foc TR4)引起的香蕉枯萎病是全球香蕉产业面临的重大土传病害,其土壤中的分生孢子和厚垣孢子是主要侵染源。构巢曲霉(Aspergillus nidulans)C2H2型锌指转录因子FlbC是调控分生孢子发育的关键因子。本研究在Foc TR4中鉴定到FlbC的同源基因FocFlbC,利用原生质体介导的遗传转化技术构建了其敲除突变体(ΔFocFlbC)和回补菌株,并分析了该蛋白的亚细胞定位和生物学功能。结果显示,FocFlbC定位于菌丝和分生孢子的细胞核。与野生型相比,ΔFocFlbC突变体在麦芽糖培养基上的菌丝生长速率显著降低,但在其他碳源培养基上无明显差异;该突变体在不同碳源培养基上的产孢量均显著降低,其中在麦芽糖培养基上野生型与突变体的产孢量比率最高,显著高于其他碳源培养基。虽然FocFlbC缺失突变对Foc TR4生物量累积和分生孢子萌发无显著影响,但与野生型相比,该突变体表现出:细胞壁和盐胁迫耐受性降低;α-淀粉酶、滤纸酶及β-1,4-D-葡聚糖酶活性下降,且相应水解酶基因的表达水平下调;以及致病力减弱。上述表型缺陷均可被回补菌株恢复。综上,FocFlbC不仅调控Foc TR4在麦芽糖培养基上的菌丝生长与产孢,还参与调控细胞壁完整性、盐胁迫响应、水解酶合成以及致病力等多个重要生物学过程,为深入揭示Foc TR4生长发育和致病分子机制奠定了理论基础。 展开更多
关键词 香蕉枯萎病菌 C2H2型锌指结构域 转录因子 碳源利用 胁迫响应 水解酶活性 致病性
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禾谷炭疽菌C2H2型转录因子CgrFlbC的生物学功能 认领 引用 被引量：3
11
作者 林少园 韦涵文 +3 位作者 郭晨晨 唐雯 柳志强 李晓宇 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2025年第4期1507-1519,共13页
【背景】禾谷炭疽菌(Colletotrichum graminicola)是一种既能够在寄主活体细胞内汲取养分,也能通过破坏寄主细胞获得养分的病原真菌。其主要寄生于禾本科植物,可以对这些植物进行侵染从而引起炭疽病。C2H2型转录因子在真菌生长发育过程... 【背景】禾谷炭疽菌(Colletotrichum graminicola)是一种既能够在寄主活体细胞内汲取养分,也能通过破坏寄主细胞获得养分的病原真菌。其主要寄生于禾本科植物,可以对这些植物进行侵染从而引起炭疽病。C2H2型转录因子在真菌生长发育过程中起着关键作用。【目的】鉴定禾谷炭疽菌中一个C2H2型转录因子CgrFlbC,阐明其在该菌中的生物学功能,为进一步解析FlbC在禾谷炭疽菌中的侵染机制提供理论支撑。【方法】采用同源重组技术分别获得禾谷炭疽菌CgrflbC基因敲除突变株及其互补菌株,对其多种表型特征进行系统分析,包括:不同营养条件下菌丝的生长、非生物胁迫因子响应、产孢及分生孢子发育情况、毒力分析等。【结果】CgrflbC编码的蛋白质由399个氨基酸组成,含有2个C2H2的锌指结构域。相较于野生型菌株,敲除突变株ΔCgrflbC生长速度减慢,对十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,SDS)和H2O2更敏感,卵圆形孢子产量增加,萌发率降低,镰刀形孢子产量降低,不能形成附着枝。【结论】CgrFlbC在禾谷炭疽菌中参与调控菌丝生长、细胞壁完整性、氧化应激响应、产孢及孢子萌发以及附着枝的形成,为深入解析禾谷炭疽菌侵染机制奠定了理论基础。 展开更多
关键词 禾谷炭疽菌 C2H2型转录因子 营养生长 致病性
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陆地棉C2H2型锌指蛋白全基因组鉴定及表达分析 认领 引用 被引量：3
12
作者 唐玉萍 彭凡嘉 +7 位作者 郭莉莉 赵瑞元 郑巨云 张志刚 陈浩东 李玉军 李彩红 梅正鼎 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2025年第15期4947-4968,共22页
C2H2锌指结构蛋白(C2H2 zinc finger protein)广泛参与植物器官形态发生、激素信号转导、逆境响应等生物学过程,在非生物逆境应激响应中发挥着重要作用。为明确陆地棉(Gossypium hirsutum L.) C2H2锌指蛋白的概况、功能及其对环境胁迫... C2H2锌指结构蛋白(C2H2 zinc finger protein)广泛参与植物器官形态发生、激素信号转导、逆境响应等生物学过程,在非生物逆境应激响应中发挥着重要作用。为明确陆地棉(Gossypium hirsutum L.) C2H2锌指蛋白的概况、功能及其对环境胁迫的应激响应模式,本研究通过拟南芥(Arabidopsis thaliana L.) C2H2锌指蛋白序列的BLAST比对映射及结合C2H2锌指结构基因家族pfam数据库从陆地棉基因组数据库筛选到343个棉花(Gossypium spp.) C2H2型锌指蛋白家族成员,并对其进行了系统进化分析、基因结构、调控序列元件及组织表达分析。结果表明,棉花C2H2型锌指蛋白家族成员可分为4个亚群,且在A和D基因组的26条染色体上均有分布。4个亚群成员在基因结构、功能、组织表达特异性和逆境响应上也呈现出显著差异。此外,发现16个Q型转录因子分别在根、茎、叶等组织中呈现明显的表达差异,且多数成员表达水平在高温、盐或重金属镉逆境胁迫下差异显著,是非生物逆境应激响应过程的重要参与者。陆地棉C2H2锌指蛋白家族成员的特征分析及其差异呈现将有助于其参与的逆境响应分子机制的进一步解析,为抗逆基因的挖掘以及C2H2锌指蛋白在棉花抗逆育种中的利用提供重要启示作用。 展开更多
关键词 棉花 C2H2 基因家族 表达分析
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暹罗炭疽菌C2H2型转录因子CsCreA参与调控营养生长、胁迫响应、孢子发育及致病性 认领 引用 被引量：1
13
作者 许寅翼 韦涵文 +3 位作者 林少园 唐雯 柳志强 李晓宇 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2025年第7期3176-3186,共11页
【背景】暹罗炭疽菌(Colletotrichum siamense)是侵染橡胶的主要病原菌之一,每年造成严重的经济损失。CreA在调控真菌生长及发育过程中发挥着重要作用。【目的】从暹罗炭疽菌中鉴定CreA的同源蛋白CsCreA,并分析其生物学功能。【方法】... 【背景】暹罗炭疽菌(Colletotrichum siamense)是侵染橡胶的主要病原菌之一,每年造成严重的经济损失。CreA在调控真菌生长及发育过程中发挥着重要作用。【目的】从暹罗炭疽菌中鉴定CreA的同源蛋白CsCreA,并分析其生物学功能。【方法】利用同源重组的方法构建暹罗炭疽菌敲除突变株ΔCscreA和互补菌株,通过测定其营养生长、胁迫因子响应、分生孢子产量及萌发、致病性等明确其功能。【结果】CscreA编码1个含有386个氨基酸的蛋白和2个典型的C2H2蛋白结构域。相较于野生型菌株,敲除突变株ΔCscreA生长速度减慢,并且对H2O2和刚果红更加敏感,对KCl敏感性下降;ΔCscreA分生孢子的产量和萌发率显著降低,致病性减弱。【结论】暹罗炭疽菌转录因子CsCreA参与调控菌株营养生长、胁迫响应、分生孢子的产生、萌发和致病过程。 展开更多
关键词 橡胶炭疽病 暹罗炭疽菌 C2H2型转录因子 生物学功能
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灵芝C2H2转录因子GlZF1的功能分析 认领 引用 被引量：1
14
作者 孙京伟 李华君 +5 位作者 王欣杰 张佩锦 梁力丹 史青云 常思源 孟丽 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2025年第10期63-74,共12页
灵芝酸作为灵芝的关键活性成分之一,在医药与保健领域具有显著的开发价值。锌指蛋白(zinc finger proteins,ZFPs)是真核生物基因组中最大的转录因子家族之一,其中C2H2型锌指蛋白在调控植物生长发育及响应环境胁迫中发挥重要作用,且对次... 灵芝酸作为灵芝的关键活性成分之一,在医药与保健领域具有显著的开发价值。锌指蛋白(zinc finger proteins,ZFPs)是真核生物基因组中最大的转录因子家族之一,其中C2H2型锌指蛋白在调控植物生长发育及响应环境胁迫中发挥重要作用,且对次生代谢产物的生物合成也具有显著的调控作用。本研究通过同源序列比对,成功获得灵芝C2H2转录因子GlZF1基因,并借助RNAi技术对其功能展开深入研究。结果显示,灵芝GlZF1基因的干扰转化子中的灵芝酸含量较野生型菌株平均提高了26%。灵芝酸生物合成途径中的关键酶基因,包括3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合酶(hmgs)、3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(hmgr)、法尼基焦磷酸合酶(fps)、鲨烯合酶(sqs)以及氧化鲨烯环化酶(osc),其表达量在干扰转化子中显著上升。此外,干扰转化子的过氧化物酶(POD)酶活力和活性氧(reactive oxygen species,ROS)水平显著提高,而超氧化物歧化酶(SOD)酶活力和脯氨酸含量则显著下降,且与抗氧化相关的基因,如过氧化氢酶(CAT1、CAT2)、谷胱甘肽过氧化物酶(GPx)和生成活性氧的NADPH过氧化物酶(NoxR)基因的表达量均显著提高。结果表明,灵芝C2H2转录因子GlZF1不仅对灵芝酸的生物合成具有调控作用,而且对灵芝的抗氧化能力也产生显著影响。实验结果将为深入理解灵芝次生代谢途径的调控机制,以及灵芝抵御不良环境的抗胁迫机制提供前期基础。 展开更多
关键词 灵芝 C2H2型锌指蛋白 灵芝酸 次生代谢 抗胁迫能力 活性氧
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RNA interference affects tumorigenicity and expression of insulin-like growth factor-1,insulin-like growth factor-1 receptor,and basic fibroblast growth factor-2 in rat C6 glioma cells 认领 引用
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作者 Wanli Dong Jin Hu +3 位作者 Shaoyan Hu Yuanyuan Wang Juean Jiang Youxin Jin 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2009年第8期597-605,共9页
BACKGROUND： Human gliomas are more likely to express basic fibroblast growth factor-2 （FGF-2） insulin-like growth factor-1（IGF-1）, and IGF-1 receptor （IGF-1R） than normal brain tissue. These factors activate si... BACKGROUND： Human gliomas are more likely to express basic fibroblast growth factor-2 （FGF-2） insulin-like growth factor-1（IGF-1）, and IGF-1 receptor （IGF-1R） than normal brain tissue. These factors activate signal transduction systems of Ras/MAPK and PI3K/Akl, which promote glioma growth. OBJECTIVE： To utilize RNA interference （RNAi） technique to down-regulate FGF-2, IGF-1, and IGF-1R gene expression, and to investigate the effects of these genes on rat C6 glioma cells, as well as the feasibility of RNAi for treating glioma. DESIGN, TIME AND SETTING： This neurooncological, randomized, controlled, in vivo and in vitro experiment, which used RNAi methodology, was performed at the Laboratory of Molecular Biology, Institute of Biochemistry, Chinese Academy of Sciences between August 2005 and February 2008. MATERIALS： Rat C6 cell lines were purchased from Shanghai Institute of Cellular Biology Affiliated to Chinese Academy of Sciences. Small interfering RNA （siRNA） was synthesized by Shanghai GenePharma. Anti-IGF-1, anti-IGF-1R, anti-FGF-2, anti-mouse and anti-rabbit IgG G1-HRP antibodies were provided by Santa Cruz Biotechnology, USA. Four to six week-old BALB/c nude mice were purchased from the Laboratory Animal Center, Chinese Academy of Sciences. METHODS： C6 glioma cells were transfected with siRNA, which was chemically synthesized in vitro to correspond to endogenous FGF-2, IGF-1, and IGF-1R genes. The inhibition ratio of targeting mRNA expression was detected by semiquantitative RT-PCR, and protein expression was determined by Western blot analysis. C6 glioma cell proliferation was observed using a growth curve C6 glioma cell apoptosis rate and cell cycle were detected by flow cytometry. C6 glioma cell growth regression was observed by transwell migration assay. In addition, nude mouse subcutaneous tumor models were used in this study. For studying the anti-tumor effects of IGF-1 and IGF-1R siRNA, two blank control groups, with six mice each, were set up： A （2.5 μg siRNA was injected one week after C6 cells were inoculated, Le., when tumor volume reached 8 mm × 8 mm） and B （siRNA was injected at the same time with C6 cells were inoculated. To study the effects of FGF-2 siRNA, the groups consisted of a blank control group, negative control group, 2.6 μg siRNA group, 4 μg siRNA group, and 5.3 μg siRNA group, with six mice each. MAIN OUTCOME MEASURES： mRNA and protein inhibition ratio of FGF-2, IGF-1, and IGF-1 R; C6 glioma cell proliferation, apoptosis, and cycle growth arrest; C6 glioma cell growth regression and subcutaneous tumorigenicity rates. RESULTS： All siRNA constructs proved to be effective. After 48 hours, transfection of 200 nmol/L siRNA resulted in a FGF-2 or IGF-1R gene inhibition ratio 〉 80% and an IGF-1 gene inhibition ratio of approximately 70%. Protein expression levels for FGF-2, IGF-1, and IGF-1R decreased in a dose-dependent manner following siRNA transfection, with an inhibition rate 〉 85%, 60%, and 50%, respectively. C6 glioma cell proliferation and apoptosis rates increased in proportion to siRNA. The apoptosis rate of C6 glioma cells induced by FGF-2, IGF-1, and IGF-1R siRNA was 39.96%, 15.07% and 22.47%, respectively （P 〈 0.01）. Transfection of 200 nmol/L IGF or IGF-1R siRNA for 48 hours suppressed C6 glioma cell migration. At 30 days after intratumoral injection of 2.6, 4, and 5.3 tJg FGF-2 siRNA, tumor growth regression rate of FGF-2 siRNA was 56%, 67%, and 86%, respectively. The tumor growth regression rate was 71.88% and 45.71%, respectively, when IGF-1 or IGF-1R siRNA was intratumorally injected 1 week after C6 glioma cell transplantation. When IGF-1 or IGF-1 R siRNA was intratumorally injected during C6 glioma cell transplantation, the tumor growth regression rate was 78.13% and 74.29%, respectively. CONCLUSION： siRNA transfection downregulated gene expression of FGF-2, IGF-1, and IGF-1R In addition, siRNA treatment markedly suppressed glioma cell proliferation, growth, and migration, and concomitantly reduced subcutaneous tumorigenicity. 展开更多
关键词 small interference RNA basic fibroblast growth factor-2 insulin-like growth factor 1 insulin-like growth factor 1 receptor C6 glioma cell line
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甘蓝锌指蛋白转录因子BoC2H2的克隆、定位与表达分析 认领 引用 被引量：3
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作者 罗绍兰 廉小平 +6 位作者 蒲敏 白晓璟 王玉奎 曾静 施松梅 张贺翠 朱利泉 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期1650-1660,共11页
C2H2型锌指蛋白是植物中最重要的转录调节子之一,主要调控植物的生长发育和胁迫应答反应。本研究通过分析自交不亲和甘蓝未授粉,自花授粉15、30和60min,异花授粉15、30和60min柱头转录组数据,筛选到一个自花授粉诱导上调表达的C2H2型锌... C2H2型锌指蛋白是植物中最重要的转录调节子之一,主要调控植物的生长发育和胁迫应答反应。本研究通过分析自交不亲和甘蓝未授粉,自花授粉15、30和60min,异花授粉15、30和60min柱头转录组数据,筛选到一个自花授粉诱导上调表达的C2H2型锌指蛋白基因,命名为BoC2H2。BoC2H2开放阅读框756bp,编码251个氨基酸残基,蛋白分子量为26.7kDa,等电点为4.62,是一种亲水性蛋白,不含信号肽和跨膜域,含有C2H2型锌指蛋白家族高度保守的ZnF_C2H2结构域。BoC2H2起始密码子上游2000 bp的核苷酸序列中含有光响应、昼夜节律、茉莉酸响应、防御和应激反应等多种顺式作用元件。通过原生质体亚细胞定位和瞬时浸染烟草,发现BoC2H2蛋白在细胞核和细胞质中表达。BoC2H2在下胚轴、叶片和花中均有表达,柱头中的表达量随发育时间而变化,开花当天后表达量降低。荧光定量PCR结果显示, BoC2H2在自花授粉和异花授粉0～60 min的表达量变化趋势与转录组分析结果基本一致。综上所述,甘蓝BoC2H2属于C2H2型锌指蛋白家族,可能参与了柱头响应花粉刺激的分子过程,这有利于揭示BoC2H2在甘蓝自交不亲和过程中的作用机制,为研究C2H2型转录因子在甘蓝自交不亲和过程中的调控机制提供依据。 展开更多
关键词 甘蓝 C2H2锌指蛋白 BoC2H2基因 自交不亲和 定位 表达分析
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植物逆境响应相关的C2H2型锌指蛋白研究进展 认领 引用 被引量：22
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作者 钟婵娟 彭伟业 +3 位作者 王冰 刘世名 戴良英 李魏 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期2356-2366,共11页
植物锌指蛋白是一类具有核酸结合作用的关键性调控蛋白。其中, C2H2型锌指蛋白在植物体内分布最为广泛,并且可以调控植物体内多种生理生化反应,例如通过识别靶标DNA,与RNA相互作用,进而调控植物的抗病性和抗逆性等。本文重点综述了近年... 植物锌指蛋白是一类具有核酸结合作用的关键性调控蛋白。其中, C2H2型锌指蛋白在植物体内分布最为广泛,并且可以调控植物体内多种生理生化反应,例如通过识别靶标DNA,与RNA相互作用,进而调控植物的抗病性和抗逆性等。本文重点综述了近年来植物C2H2型锌指蛋白在调控植物抗逆境胁迫、抗病和生长发育方面的生物学功能及分子机制。 展开更多
关键词 C2H2型锌指蛋白 转录因子 核酸结合 逆境胁迫
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一个新的水稻C2H2型锌指蛋白cDNA的克隆与序列分析 认领 引用 被引量：29
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作者 黄骥 张红生 +3 位作者 曹雅君 王东 王建飞 杨金水 《南京农业大学学报》 CAS 北大核心 2002年第2期110-112,共3页
关键词 水稻 C2H2 锌指蛋白 cDNA 克隆 序列分析
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植物C2H2型锌指蛋白的结构与功能 认领 引用 被引量：76
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作者 黄骥 王建飞 张红生 《遗传》 CAS 北大核心 2004年第3期414-418,共5页
锌指蛋白是一类具有指状结构域的转录因子。根据半胱氨酸(C)和组氨酸(H)残基的数目和位置可将锌指蛋白分为C2H2、C2HC、C2C2、C2HCC2C2、C2C2C2C2等亚类。C2H2型锌指蛋白是最多也是研究最为清楚的一类锌指蛋白,在植物中已经克隆了50多个... 锌指蛋白是一类具有指状结构域的转录因子。根据半胱氨酸(C)和组氨酸(H)残基的数目和位置可将锌指蛋白分为C2H2、C2HC、C2C2、C2HCC2C2、C2C2C2C2等亚类。C2H2型锌指蛋白是最多也是研究最为清楚的一类锌指蛋白,在植物中已经克隆了50多个,主要涉及植物的生长发育和对环境胁迫的应答反应。该类锌指蛋白大部分在锌指区具有植物中特有的QALGGH保守结构,可能涉及调控植物特有的生物学功能。文章主要讨论了植物C2H2型锌指转录因子的结构、对靶DNA的识别及在生长发育和环境胁迫反应中可能的调控功能。 展开更多
关键词 转录因子 C2H2锌指蛋白 结构 功能
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木薯C2H2型锌指蛋白转录因子家族全基因组鉴定及表达分析 认领 引用 被引量：14
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作者 井建玲 张鹏 +1 位作者 王振宇 马秋香 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期2664-2676,共13页
锌指蛋白转录因子(zinc-finger protein transcription factor, ZFP)是一种具有特定结构的蛋白,是真核生物重要转录因子之一,其通过与核内其他因子相互作用,调控各种生理反应,参与植物的生长发育和生物与非生物胁迫。目前对木薯锌指蛋... 锌指蛋白转录因子(zinc-finger protein transcription factor, ZFP)是一种具有特定结构的蛋白,是真核生物重要转录因子之一,其通过与核内其他因子相互作用,调控各种生理反应,参与植物的生长发育和生物与非生物胁迫。目前对木薯锌指蛋白家族的研究依然较少。本研究利用木薯基因组数据库筛选鉴定了85个木薯C2H2型锌指蛋白转录因子家族成员,利用生物信息学手段分析该家族基因的结构特征和理化性质,结果表明同一C2H2型锌指蛋白家族的基因结构及氨基酸序列长度存在显著差异,大致可分为6个亚家族,各成员具有特征性的锌指结构域,但数量上存在差异;染色体定位显示该家族成员并非定位于木薯所有的18条染色体,在13号和16号染色体上没有C2H2型锌指蛋白家族成员定位。结合已有的转录组数据分析其在不同组织及非生物胁迫下的表达模式,发现各成员在不同组织中的表达模式不同,各组织均有高表达的基因,部分成员无组织表达差异,部分家族成员响应非生物胁迫。因此,木薯C2H2型锌指蛋白转录因子在植物生长发育和响应非生物胁迫功能方面具有重要的作用。 展开更多
关键词 木薯 C2H2型锌指蛋白转录因子 基因家族 生物信息学
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