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基于“3414”试验的旱地优质稻氮磷钾推荐施肥量 认领 引用
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作者 杨云秀 胡钰 +3 位作者 张贺 李颖 黄惠川 刘屹湘 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2026年第4期148-156,共9页
【目的】分析不同氮磷钾施肥量对旱地优质稻(next generation dryland rice,NGDR)农艺性状、产量、养分吸收和稻瘟病发病率的影响,为NGDR的合理施肥提供科学依据和数据支撑。【方法】以滇禾优615为材料,在云南省普洱市澜沧拉祜族自治县... 【目的】分析不同氮磷钾施肥量对旱地优质稻(next generation dryland rice,NGDR)农艺性状、产量、养分吸收和稻瘟病发病率的影响,为NGDR的合理施肥提供科学依据和数据支撑。【方法】以滇禾优615为材料,在云南省普洱市澜沧拉祜族自治县开展“3414”测土配方施肥试验,对NGDR的农艺性状、产量、养分吸收和稻瘟病发病情况进行测定,并利用一元二次和三元二次肥料效应函数确定澜沧山区NGDR的推荐施肥量。【结果】施肥提高了NGDR的生物量和产量,其中生物量以N2P2K1处理(N 45.00 kg/hm2、P2O545.00 kg/hm2、K2O 22.50 kg/hm2)最高,籽粒产量以N2P1K1处理(N 45.00 kg/hm2、P2O522.50 kg/hm2、K2O 22.50 kg/hm2)最高。在养分吸收方面,N2P2K2处理(N、P2O5和K2O均为45.00 kg/hm2)的综合表现最佳。此外,N0P2K2处理(N 0.00 kg/hm2、P2O545.00 kg/hm2、K2O 45.00 kg/hm2)的稻瘟病发病率最低。【结论】根据三元二次肥料效应函数得出澜沧山区NGDR最佳经济产量施肥量为N 31.96 kg/hm2、P2O555.94 kg/hm2、K2O 52.66 kg/hm2,最佳经济产量为6031.81 kg/hm2 展开更多
关键词 旱地优质稻 “3414”肥效试验 肥料效应函数 推荐施肥量
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基于KMP算法的next函数理解与分析 认领 引用 被引量:3
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作者 周雅翠 孙磊 《吉林建筑工程学院学报》 2012年第1期79-82,共4页
在字符串模式匹配算法的研究过程中,KMP算法是基于常规的BF算法的一种改进算法,而其中next函数值的求解过程更是该算法的重要内容.本文以原算法的求解过程作为基础,通过对next函数值求解过程的算法改进和模式字符匹配串匹配过程的描述,... 在字符串模式匹配算法的研究过程中,KMP算法是基于常规的BF算法的一种改进算法,而其中next函数值的求解过程更是该算法的重要内容.本文以原算法的求解过程作为基础,通过对next函数值求解过程的算法改进和模式字符匹配串匹配过程的描述,从而增强对KMP算法的理解.本文利用C语言实现了改进后的next函数值求解算法. 展开更多
关键词 KMP算法 next函数 模式匹配
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粉尘螨体内微生物群落多样性及功能基因的宏基因组分析 认领 引用
3
作者 杨亚雯 洪钰婕 +7 位作者 钱格格 凌敏 王子璇 俞慧 孙怀宇 陶香林 李敏洁 孙恩涛 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CSCD 北大核心 2025年第3期395-402,共8页
目的研究粉尘螨体内微生物群落的组成、结构和功能,并分析其功能基因特征。方法采集3份粉尘螨样品(每份150只),提取3份粉尘螨总DNA,构建双末端测序文库。桥式PCR扩增后进行宏基因组测序。将获得的基因序列与非冗余蛋白(NR)、直系同源蛋... 目的研究粉尘螨体内微生物群落的组成、结构和功能,并分析其功能基因特征。方法采集3份粉尘螨样品(每份150只),提取3份粉尘螨总DNA,构建双末端测序文库。桥式PCR扩增后进行宏基因组测序。将获得的基因序列与非冗余蛋白(NR)、直系同源蛋白分组比对(EggNOG)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、碳水化合物活性酶(CAZY)、全面抗生素抗性(CARD)等数据库进行BLAST比对。采用α多样性指数实际观测物种数指数、Ace指数、Chao1指数、香农多样性指数、辛普森多样性指数、覆盖度指数分析粉尘螨体内微生物的基因多样性。结果3份粉尘螨样品宏基因组测序获得1.18×107~1.29×107个碱基。经拼接后,得到的重叠群数目为34527个,N50为25005个,重叠群的平均长度为11509个。对粉尘螨体内微生物预测基因进行物种注释,选取水平上相对丰度前20位的物种进行分析,共注释到粉尘螨体内微生物73门430属689种,其中细菌最为丰富,占80.9%,其次为病毒(5.5%),再次为真菌(1.2%)。在细菌群落中,假单胞菌门(97.8%)和厚壁菌门(0.8%)是优势菌门,巴尔通体属(59.0%)和未分类的α变形菌属(11.0%)为优势菌属。在真菌群落中,微孢子门(66.6%)和子囊菌门(19.6%)占主导地位,Pancytospora(41.4%)和Saccharomyces(12.2%)为优势菌属。在病毒群落中,Cressdnaviricota(96.2%)和Uroviricota(2.6%)为优势菌门,环状病毒属(96.2%)为优势菌属。α多样性结果显示,3份粉尘螨样品重复性好。EggNOG数据库蛋白序列注释结果显示,细菌和真菌分别注释到23和22种功能类别,其中翻译/核糖体结构和生物发生类别的基因数在细菌(15.3%)和真菌(27.4%)中均占比最高。KEGG数据库分析基因功能结果显示,细菌中辅因子和维生素的代谢相关基因占主导地位(10.5%),在真菌中,折叠、分类和降解相关的基因更为突出(12.0%)。CAZY数据库对碳水化合物代谢酶家族的注释结果表明,在细菌中,高达98.3%的基因能够成功匹配到65个不同的碳水化合物代谢酶家族,其中以糖基转移酶家族占主导地位(57.6%)。真菌中仅有0.4%的基因能够注释到12个碳水化合物代谢酶家族,糖基转移酶家族也是主要酶家族(87.7%)。CARD数据库的抗性基因注释结果显示,在细菌中,99.1%的基因能够注释到17种不同的抗生素抗性基因,其中多重耐药性基因占比最高(39.5%)。在真菌中,0.3%的基因能够注释到5种抗生素抗性基因,以四环素抗性基因和多重耐药性基因为主,分别占41.6%和39.7%。结论粉尘螨体内微生物群落存在复杂性和多样性,细菌和真菌在基因功能和代谢途径存在差异。 展开更多
关键词 粉尘螨 宏基因组测序 微生物群落 功能基因
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基于RBF神经网络的光滑不确定模型自适应采样方法 认领 引用 被引量:2
4
作者 郑源 李艳 +2 位作者 高峰 张旭涛 杨勃 《计算机集成制造系统》 EI CSCD 北大核心 2025年第8期2920-2929,共10页
由于缺少关于廓形的先验知识,具有不确定性被测表面的重构精度取决于采样方法的自适应程度,即在测量过程中对下一采样点的实时合理设置。利用径向基函数神经网络(RBFNN)的非线性映射能力预测被测光滑表面备选采样点的几何特征响应,并将... 由于缺少关于廓形的先验知识,具有不确定性被测表面的重构精度取决于采样方法的自适应程度,即在测量过程中对下一采样点的实时合理设置。利用径向基函数神经网络(RBFNN)的非线性映射能力预测被测光滑表面备选采样点的几何特征响应,并将其不确定度估计代入提出的考虑轮廓曲率影响的MaxCWVar信息标准中用于选择下一最优测点(NBP)。以叶片截面自由曲线为例,验证了该方法自适应采样性能的优越性。与其他自适应采样策略的对比表明,基于RBFNN的响应预测对于采样点位置确定具有很好的指导作用;与其他三个常用的NBP选择标准相比,根据MaxCWVar标准得到的采样点分布更为合理,能及时准确地跟随轮廓的几何特征变化,经样本密度与曲率之间的相关性分析得以验证。特别是对采样实时性有较高要求的情况下,所提出方法具有更好的重构精度和建模效率。研究成果对于探索快速、智能的复杂无模型光滑曲面重构方法具有启发意义。 展开更多
关键词 不确定模型 自适应采样 径向基函数神经网络 MaxCWVar信息标准 下一最优测点
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The Next-Hop Node Selection Based GPSR in Vehicular Ad Hoc Networks 认领 引用
5
作者 Zhaoyuan Cui Demin Li +2 位作者 Guanglin Zhang Chang Guo Yong Sheng 《Journal of Computer and Communications》 2016年第10期44-56,共13页
Vehicular Ad hoc Networks (VANETs) which is a special form of Mobile Ad hoc Networks (MANETs) has promising application prospects in the future. Due to the rapid changing of topology structure, how to find a route whi... Vehicular Ad hoc Networks (VANETs) which is a special form of Mobile Ad hoc Networks (MANETs) has promising application prospects in the future. Due to the rapid changing of topology structure, how to find a route which can guarantee Quality of Service (QoS) is an important issue in VANETs. This paper presents an improved Greedy Perimeter Stateless Routing (GPSR) protocol based on our proposed next-hop node selection mechanism. Firstly, we define the link reliability in two cases which take the movement direction angle between two vehicles into consideration. Then we propose a next-hop node selection mechanism based on a weighted function which consists of link reliability between the sender node and next-hop candidate node, distance between next-hop candidate node and the destination, movement direction angle of next-hop candidate node. At last, an improved GPSR protocol is proposed based on the next-hop node selection mechanism. Simulation results are presented to evaluate the performance of the improved GPSR protocol, which shows that the performance including packet delivery ratio and average end-to-end delay of the proposed protocol is better in some situations. 展开更多
关键词 VANETs GPSR Next-Hop Node Selection Link Reliability Weighted Function
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免疫功能正常肺孢子菌肺炎1例并文献复习 认领 引用
6
作者 梁快 朱雨柔 +2 位作者 金菁 徐春秀 王世强 《中国当代医药》 CAS 2025年第1期164-167,共4页
肺孢子菌肺炎(PCP)是一种在免疫功能正常人群中罕见的机会性真菌感染。浙江中医药大学附属杭州市中医院收治1例免疫功能正常患者,临床表现为发热、咳嗽和呼吸困难,胸部CT示弥漫性磨玻璃病变,结合宏基因组二代测序、聚合酶链式反应和G试... 肺孢子菌肺炎(PCP)是一种在免疫功能正常人群中罕见的机会性真菌感染。浙江中医药大学附属杭州市中医院收治1例免疫功能正常患者,临床表现为发热、咳嗽和呼吸困难,胸部CT示弥漫性磨玻璃病变,结合宏基因组二代测序、聚合酶链式反应和G试验结果确诊PCP,经复方磺胺甲噁唑片联合甲泼尼龙治疗,预后良好。非HIV感染患者PCP起病急骤,病情进展快,因此早期诊断、有效干预是改善预后的关键。通过分析本例患者的临床特点、治疗过程,为临床诊治该类疾病提供参考。 展开更多
关键词 肺孢子菌肺炎 免疫功能正常 宏基因组二代测序 聚合酶链式反应 G试验
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基于慢性阻塞性肺疾病不同肺功能严重程度患者诱导痰微生态多样性研究 认领 引用 被引量:3
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作者 崔玉娟 余艳芳 +1 位作者 李琼 梁凯轶 《临床肺科杂志》 2025年第2期200-208,共9页
目的使用深度宏基因组测序(Metagenomic sequencing,mNGS)技术(单个样本原始数据量>=12G),比较不同肺功能分级慢性阻塞性肺疾病(简称慢阻肺)患者诱导痰微生物组的物种和基因功能差异,探索诱导痰微生物组种群和基因功能变化与肺功能... 目的使用深度宏基因组测序(Metagenomic sequencing,mNGS)技术(单个样本原始数据量>=12G),比较不同肺功能分级慢性阻塞性肺疾病(简称慢阻肺)患者诱导痰微生物组的物种和基因功能差异,探索诱导痰微生物组种群和基因功能变化与肺功能的关系,为慢阻肺肺功能损伤机制提供线索。方法选取2022年1月-2023年10月在上海嘉定区中心医院呼吸与危重症医学科诊断为慢阻肺的患者49例,根据肺功能分级分为轻度组(FEV1pred≥50%,n=21),中度组(30%≤FEV1pred<50%,n=13)和重度组(FEV1pred<30%,n=15)。收集患者诱导痰液,然后进行DNA提取、非靶向宏基因组下一代测序(mNGS)和生物信息学分析,比较各亚组Alpha、Beta多样性、菌群构成及相对丰度的差异,并使用KEGG数据库、eggNOG数据库、cazy数据库进行基因和功能差异分析。结果研究发现,三组之间的Alpha多样性存在显著差异,Beta多样性、物种构成及相对丰度无统计学差异。在属水平,沙尔菌属(Schaalia)、罗斯氏菌属(Rothia)在重度组中丰度较高,纤毛菌属(Leptotrichia)在轻度组中丰度更高;在种水平,黏液罗氏菌(Rothia mucilaginosa)、龋齿放线菌(Schaalia odontolytica)和邻接短链小球菌(Granulicatella adiacens)在重度组中丰度较高。LEfSe(LDA Effect Size)分析结果显示,K13993(Hsp20蛋白家族)、GH89(α-N-乙酰氨基葡萄糖酶家族)、CBM61(碳水化合物结合模块家族61)丰度在轻度组比中度组、重度组中丰度高。结论随着肺功能下降,慢性阻塞性肺病患者微生物组多样性降低,部分蛋白家族丰度发生改变。这些发现表明,慢阻肺患者痰液微生物组群落失调与肺功能损伤的严重程度有关。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 宏基因测序 诱导痰 肺功能
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急诊绿色通道模式下一站式护理在急性心肌梗死患者中的应用效果 认领 引用 被引量:4
8
作者 史莲莉 黄桂先 +2 位作者 顾书臣 张轶 赵叶青 《护理实践与研究》 2025年第9期1386-1391,共6页
目的探讨在急诊绿色通道模式中实施一站式护理对急性心肌梗死患者应激障碍和生活质量的改善效果。方法选取苏州市立医院在2022年1月—2023年12月接收的102例急性心肌梗死患者为研究对象,按照组间基线资料可比的原则分为对照组和观察组,... 目的探讨在急诊绿色通道模式中实施一站式护理对急性心肌梗死患者应激障碍和生活质量的改善效果。方法选取苏州市立医院在2022年1月—2023年12月接收的102例急性心肌梗死患者为研究对象,按照组间基线资料可比的原则分为对照组和观察组,各51例,对照组患者接受常规急诊护理,观察组患者接受急诊绿色通道模式下一站式护理。比较两组患者护理前后的心功能水平[左心室射血分数(LVEF)、左室舒张末期容积(LVEDV)、氨基末端脑利钠肽前体(NT-proBNP)]、应激障碍[斯坦福急性应激反应问卷(SASRQ)评分]、希望水平[Herth希望量表(HHI)]及生活质量[中国心血管病人生活质量评定问卷(CQQC)]。结果与护理前比较,护理后两组患者的LVEDV、NT-proBNP及SASRQ评分水平降低,LVEF、HHI评分、CQQC评分升高,且以上指标观察组优于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论急诊绿色通道模式下一站式护理能改善急性心肌梗死患者的心功能和应激障碍,提升患者的希望水平及生活质量。 展开更多
关键词 急诊绿色通道模式 一站式护理 急性心肌梗死 心功能 应激障碍
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宣恩火腿发酵过程中表面微生物群落演替规律 认领 引用 被引量:7
9
作者 邓祥宜 李继伟 +4 位作者 何立超 张原源 黄国威 鲍晓龙 邱朝坤 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期34-42,共9页
为揭示宣恩火腿发酵过程中微生物群落演替规律,运用高通量测序技术分析不同发酵时间火腿表面细菌和真菌群落组成,并对物种相关性和微生物群落功能进行分析。结果表明:宣恩火腿表面细菌群落多样性在发酵过程中持续增加,共检出11个门和96... 为揭示宣恩火腿发酵过程中微生物群落演替规律,运用高通量测序技术分析不同发酵时间火腿表面细菌和真菌群落组成,并对物种相关性和微生物群落功能进行分析。结果表明:宣恩火腿表面细菌群落多样性在发酵过程中持续增加,共检出11个门和96个属;发酵前、中期,木糖葡萄球菌(Staphylococcus xylosus)占绝对优势(>98%),发酵后期主要优势属为葡萄球菌属(Staphylococcus)、沙雷氏菌属(Serratia)和甲基菌属(Methylobacterium)。宣恩火腿表面真菌群落多样性相对稳定,共检出3个门和8个属;发酵前、中期的优势属为曲霉属(Aspergillus)、未分类真菌g_unclassified_k_Fungi(OTU7)和节菌属(Wallemia),发酵后期的优势属为曲霉属、未分类真菌和酵母(g_unclassified_o_Saccharomycetales)。物种相关性网络分析结果表明,曲霉属Aspergillus cibarius和木糖葡萄球菌呈正相关,与其他细菌呈负相关;帚状曲霉(Aspergillus penicillioides)、未分类酵母与木糖葡萄球菌呈负相关,与其他细菌呈正相关。功能预测结果表明,细菌和真菌均对宣恩火腿中蛋白质、脂肪的降解有重要作用。该研究揭示了宣恩火腿发酵过程中表面微生物群落演替规律,可为人工接种生产火腿提供参考,以便进一步改善火腿品质、缩短加工周期和提升安全性。 展开更多
关键词 宣恩火腿 发酵过程 微生物区系 细菌多样性 真菌多样性 下一代测序技术 功能预测
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宏基因组学技术的研究与挑战 认领 引用 被引量:20
10
作者 周丹燕 戴世鲲 +1 位作者 王广华 李翔 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期591-600,共10页
宏基因组学研究作为研究微生物种群生态分布、群体遗传特征和基因相互作用的新兴学科领域,在很大程度上促进了环境微生物资源,特别是未培养微生物资源的开发利用,在土壤、海洋、人体医学、药物等各个领域的应用中取得了突破性的进展,为... 宏基因组学研究作为研究微生物种群生态分布、群体遗传特征和基因相互作用的新兴学科领域,在很大程度上促进了环境微生物资源,特别是未培养微生物资源的开发利用,在土壤、海洋、人体医学、药物等各个领域的应用中取得了突破性的进展,为发现新的生物活性物质提供了新的有效途径。就宏基因组学研究进展进行综述,并重点介绍了宏基因组学研究中的机遇及挑战。 展开更多
关键词 宏基因组学 宏基因组文库 序列筛选 功能筛选 新一代测序
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KMP模式匹配算法的研究分析 认领 引用 被引量:9
11
作者 杨战海 《计算机与数字工程》 2010年第5期38-41,共4页
通过对字符串模式匹配算法和KMP算法的研究,分析了一种改进KMP算法的方法,并通过对算法的复杂性进行计算,结果表明,改进后的KMP算法和KMP算法的时间复杂度均为O(m+n),但改进后算法的平均比较次数约为未改进算法的平均比较次数的0.833倍... 通过对字符串模式匹配算法和KMP算法的研究,分析了一种改进KMP算法的方法,并通过对算法的复杂性进行计算,结果表明,改进后的KMP算法和KMP算法的时间复杂度均为O(m+n),但改进后算法的平均比较次数约为未改进算法的平均比较次数的0.833倍,因此改进后的KMP算法更能提高字符串模式匹配的工作效率。 展开更多
关键词 模式匹配 KMP算法 算法 next函数
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能源植物高粱基因组研究进展 认领 引用 被引量:9
12
作者 罗洪 张丽敏 +4 位作者 夏艳 吴小园 王聪 刘智全 景海春 《科技导报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第16期17-26,共10页
回顾了高粱基因组学研究的发展进程,概述了初期组学数据的积累、参考基因组的破译及新一代测序技术和数据分析方法引领下的组学研究进展;介绍了高粱基因组的结构,从比较基因组学的角度,分析了高粱基因组的进化及其特性;探讨了高粱功能... 回顾了高粱基因组学研究的发展进程,概述了初期组学数据的积累、参考基因组的破译及新一代测序技术和数据分析方法引领下的组学研究进展;介绍了高粱基因组的结构,从比较基因组学的角度,分析了高粱基因组的进化及其特性;探讨了高粱功能基因组的研究方法和研究进展,总结了已经发掘的高粱关键基因和遗传位点,对高粱组学数据资源进行了归纳。对高粱基因组学的发展方向进行了展望。 展开更多
关键词 高粱基因组 新一代测序技术 比较与功能基因组学 重要QTL和基因 生物质能源性状
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宏基因组学二代测序在免疫功能受损不明原因肺部感染患者病原鉴别中的意义 认领 引用 被引量:8
13
作者 张弦 顾宇峰 +4 位作者 赵华 周跃 金爱萍 张彬 张海峰 《交通医学》 2020年第3期242-245,共4页
目的 :探讨宏基因组学二代测序(mNGS)技术在免疫功能受损不明原因肺炎患者病原鉴别中的作用。方法:CD4+T淋巴细胞降低的不明原因肺部感染患者20例留取标本传统细菌培养,于入院当日及24小时后检测两次新冠病毒核酸阴性后外送病原mNGS检... 目的 :探讨宏基因组学二代测序(mNGS)技术在免疫功能受损不明原因肺炎患者病原鉴别中的作用。方法:CD4+T淋巴细胞降低的不明原因肺部感染患者20例留取标本传统细菌培养,于入院当日及24小时后检测两次新冠病毒核酸阴性后外送病原mNGS检测。比较细菌培养与mNGS病原二代测序结果对不明原因肺炎病原诊断的差异。结果:20例患者共送检23份标本检测病原mNGS,其中无菌标本病原mNGS共15例,结果 4例血标本未检测到任何病原体,其余11例共报告病原体18例次;非无菌标本病原mNGS检出的病原体数量和种类明显多于无菌标本,8例患者均有阳性病原体报告21例次。而传统细菌真菌培养仅2例报告了白色念珠菌,未见其他病原体阳性报告。结论:mNGS对免疫功能受损不明原因肺炎病原,尤其是条件致病病原学诊断具有更高敏感性,有助于更早识别病原体和指导治疗用药。 展开更多
关键词 不明原因 肺部感染 免疫功能 宏基因组学二代测序 病原体
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一种改进的KMP入侵检测的模式匹配算法 认领 引用 被引量:3
14
作者 赵森严 黄伟 李阳铭 《井冈山大学学报(自然科学版)》 2013年第1期55-57,共3页
提出了一种基于KMP的模式匹配算法,给出了具体的实现方法。在不丢失匹配项的前提下,增大next函数的值,使得模式串向右尽可能得滑动更远的一段距离,忽略不必要的比较。通过实验证明,该方法与传统的方法相比能有效地加快匹配的速度,提高... 提出了一种基于KMP的模式匹配算法,给出了具体的实现方法。在不丢失匹配项的前提下,增大next函数的值,使得模式串向右尽可能得滑动更远的一段距离,忽略不必要的比较。通过实验证明,该方法与传统的方法相比能有效地加快匹配的速度,提高入侵检测的效率。 展开更多
关键词 KMP算法 模式匹配 next函数 入侵检测
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基于新一代测序技术的A^2O与BIOLAK活性污泥宏基因组比较分析 认领 引用 被引量:7
15
作者 田美 刘汉湖 申欣 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第2期638-646,共9页
本研究是A2O(anaerobic/anoxic/oxic,厌氧/缺氧/好氧)与百乐克(BIOLAK)活性污泥宏基因组比较分析的首份报告.在百乐克和A2O活性污泥宏基因组中,分别检测到47个和51个门类,超过了澳大利亚强化生物除磷(enhanced biological phosphorus re... 本研究是A2O(anaerobic/anoxic/oxic,厌氧/缺氧/好氧)与百乐克(BIOLAK)活性污泥宏基因组比较分析的首份报告.在百乐克和A2O活性污泥宏基因组中,分别检测到47个和51个门类,超过了澳大利亚强化生物除磷(enhanced biological phosphorus removal,EBPR)、美国强化生物除磷和Bibby活性污泥中所检测到的生物类群.百乐克活性污泥中所发现的门类,均在A2O活性污泥中检测到.但是,有4个门类仅在A2O活性污泥中出现.Ignavibacteriae门在A2O活性污泥宏基因组中的比例(2.044 0%)是百乐克活性污泥(0.637 6%)的3.2倍.与此同时,芽单胞菌门在百乐克活性污泥宏基因组中的比例是2.467 3%,比其在A2O活性污泥中的比例(0.140 4%)高出17倍多;衣原体门在百乐克活性污泥宏基因组中的比例是0.219 2%,比其在A2O活性污泥中的比例(0.036 0%)高出6倍多.另外,在属的层级,有167个属仅在A2O活性污泥中检出;与此同时,有50个属仅发现于百乐克活性污泥中.因此,在门和属的层级,A2O与百乐克活性污泥的生物群落均存在巨大差异.然而,在百乐克和A2O两个活性污泥中,与氮、磷、硫和芳香族化合物代谢相关的功能基因比例均是非常接近的.此外,两个活性污泥中KEGG(Kyoto Encyclopedia for Genes and Genomes,京都基因与基因组百科全书)所有6个类别的排序均相同.同时,氮代谢相关的功能基因分类和通路分析表明,高丰度酶在百乐克和A2O宏基因组中具有相同的排序.因此,A2O和百乐克活性污泥宏基因组比较分析显示,两个不同的生物群落具有相似的功能分配. 展开更多
关键词 活性污泥 宏基因组 功能分配 生物群落 新一代测序技术
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辽河油田油泥微生物多样性分析及功能菌种筛选评价 认领 引用 被引量:7
16
作者 陈箐 程昉 +4 位作者 宋晓峰 林佳伟 董洋 何炜 赵静 《东北石油大学学报》 CAS 北大核心 2017年第6期105-111,共7页
分析辽河油田某区块不同来源油泥中微生物种类多样性、优势菌群和分布特征,探讨功能微生物在含油污染物的生物修复及提高原油采收率的应用可行性。采集辽河油田某区块3个油泥样品,利用第二代高通量测序技术测定油泥样品内微生物的16SrDN... 分析辽河油田某区块不同来源油泥中微生物种类多样性、优势菌群和分布特征,探讨功能微生物在含油污染物的生物修复及提高原油采收率的应用可行性。采集辽河油田某区块3个油泥样品,利用第二代高通量测序技术测定油泥样品内微生物的16SrDNA V3-V4可变区序列,整理和统计各分类水平的微生物类群数,分析微生物的丰度、分布和多样性,以及不同位置油泥微生物多样性丰度的差异。结果表明:辽河油田某区块油泥中3组样品属水平的微生物类群数分别为51、135和213,不同来源样品中微生物种类及所占比例差异显著;优势菌群中含有多种已报道可作用原油的功能微生物,如芽孢杆菌属(Bacillus)和诺卡氏土壤菌属(Nocardiopsis)等;从油泥中筛选的菌株LH-03发酵液表面张力为29.3mN/m,对煤油和液体石蜡乳化层高度分别为6.1和5.7cm,经鉴定为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis),与Pseudomonas aeruginosa CB-01复配使用,油泥降解实验除油率达到51.9%,石蜡降解率达到38.9%,填砂管驱油实验可在水驱基础上提高采收率12.7%。辽河油田油泥含有较丰富的微生物修复物质基础,具备通过生物刺激和强化技术实现原位生物修复的可行性。 展开更多
关键词 辽河油田 油泥 第二代测序技术 微生物多样性 功能菌种筛选
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热带植物基因组研究进展 认领 引用 被引量:1
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作者 李丹 陈晓慧 赖钟雄 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2019年第10期1875-1888,共14页
基于全基因组测序结果,探讨了包括热带水果香蕉(Musa spp.)、龙眼(Dimocarpus longan)、番木瓜(Carica papaya)、菠萝(Ananas comosus)、椰子(Cocos nucifera)、榴莲(Durio zibethinus),经济作物橡胶(Hevea brasiliensis)、木薯(Manihot... 基于全基因组测序结果,探讨了包括热带水果香蕉(Musa spp.)、龙眼(Dimocarpus longan)、番木瓜(Carica papaya)、菠萝(Ananas comosus)、椰子(Cocos nucifera)、榴莲(Durio zibethinus),经济作物橡胶(Hevea brasiliensis)、木薯(Manihot esculenta)、枣椰(Phoenix dactylifera)、可可(Theobroma cacao)、油棕(Elaeis guineensis)、咖啡(Coffea canephora)以及药用植物铁皮石斛(Dendrobium officinale)在内的13种热带植物的全基因组测序的发展历程,并对热带植物基因组研究进行了概述。 展开更多
关键词 热带植物 全基因组 第二代测序 遗传育种 功能基因
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中国野生小鼠来源1号染色体替换系缺失突变的发掘及功能注释 认领 引用
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作者 徐福意 晁天柱 +4 位作者 胡世贤 李凯 周宇荀 周梁良 肖君华 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期20-24,共5页
目的基于野生小家鼠来源1号染色体替换系群体(population of specific chromosome 1 substitution strains,PCSSs)中18个品系的全基因组重测序结果,鉴定1号染色体上的缺失突变并对其进行功能注释。方法采用Illumina二代测序平台获取18... 目的基于野生小家鼠来源1号染色体替换系群体(population of specific chromosome 1 substitution strains,PCSSs)中18个品系的全基因组重测序结果,鉴定1号染色体上的缺失突变并对其进行功能注释。方法采用Illumina二代测序平台获取18个品系的全基因组序列信息,通过Speed Seq软件鉴定缺失突变,进一步利用Snp Eff软件完成功能注释。结果在18个品系的1号染色体上共检测到13 803个缺失突变。缺失长度从51 bp到70 kb不等,其中长度<500 bp的缺失突变约占总数的50%。多数缺失突变位于内含子区(50.361%)和基因间隔区(28.745%)。发现31个蛋白编码基因含有功能性缺失,其中有3个基因和人类疾病相关,7个基因参与了11条KEGG通路。结论 PCSSs的1号染色体上含有丰富的缺失突变,是在研究复杂性状的重要遗传标记。 展开更多
关键词 缺失突变鉴定 二代测序 功能注释 PCSSs
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扭环型计数器自启动设计的逻辑修改方案 认领 引用 被引量:10
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作者 任骏原 《吉林大学学报(信息科学版)》 CAS 2011年第4期332-338,共7页
为了克服目前在保持右移移位寄存器内部结构不变的基础上只求解第1位触发器的激励函数设计方法的局限性,分析了扭环形计数器工作时的状态转换过程,提出在不改变右移移位、取反循环移位的状态变化规律时可对任何一位触发器的激励函数进... 为了克服目前在保持右移移位寄存器内部结构不变的基础上只求解第1位触发器的激励函数设计方法的局限性,分析了扭环形计数器工作时的状态转换过程,提出在不改变右移移位、取反循环移位的状态变化规律时可对任何一位触发器的激励函数进行逻辑修改的设计方案,给出了在次态函数卡诺图上进行激励函数最小化求解与检查无效状态所赋次态值及逻辑修改同步进行的自启动设计方法,简化了扭环形计数器的设计过程。 展开更多
关键词 扭环形计数器 自启动 次态卡诺图 逻辑修改 激励函数
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下一代益生菌作用机制及功能特性研究进展 认领 引用 被引量:4
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作者 焦帅 付域泽 张乃锋 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期4836-4846,共11页
高通量测序等技术在肠道微生态领域的发展加速了我们对肠道微生物组成和功能的了解,扩大了新发现菌成为潜在益生菌的范围。第一代益生菌主要是乳酸菌、酵母菌和芽孢杆菌等,主要作用是预防和保健。下一代益生菌(NGPs)是指目前还未被纳入... 高通量测序等技术在肠道微生态领域的发展加速了我们对肠道微生物组成和功能的了解,扩大了新发现菌成为潜在益生菌的范围。第一代益生菌主要是乳酸菌、酵母菌和芽孢杆菌等,主要作用是预防和保健。下一代益生菌(NGPs)是指目前还未被纳入饲料工业生产的,当给予足够的剂量时,能通过特定途径和调节特性对机体健康产生影响,可预防和治疗机体代谢障碍或改善宿主健康功能的活性微生物。下一代益生菌主要的候选菌群有拟杆菌属、嗜黏蛋白阿克曼菌和产丁酸菌等。本文就下一代益生菌的候选菌群、作用机制、功能特性和安全评估进行综述,进一步明确下一代益生菌在调控肠道微生物区系平衡和调节宿主新陈代谢、缓解炎症反应、改善动物腹泻等方面的作用,为下一代益生菌的开发利用提供参考。 展开更多
关键词 下一代益生菌 候选菌群 作用机制 功能特性 安全评估
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