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Isolation and Identification of Burkholderia gladioli pathovar cocovenenans from Black Fungus and Characteristics of the Bon Gene Cluster-Shanghai Municipality,China,2023 认领 引用
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作者 Quan Xiao Chengbing Dai +9 位作者 Xinyu Hong Zhixin Fang Jiawei Zhao Haijian Zhou Xin Liu Libei Xiong Qingli Dong Min Chen Huanyu Wu Hongzhi Zhang 《China CDC weekly》 SCIE CSCD 2025年第25期869-873,共5页
Objective:Burkholderiagladioli(B.gladioli)pathovar cocovenenans(BG),a foodborne pathogen,can cause lethal poisoning.Most cases have been reported_in China,primarily originating from fermented cereal products.In this s... Objective:Burkholderiagladioli(B.gladioli)pathovar cocovenenans(BG),a foodborne pathogen,can cause lethal poisoning.Most cases have been reported_in China,primarily originating from fermented cereal products.In this study,we investigated the prevalence of BGC contamination in commercially available fungi and analyzed the environmental conditions for bongkrekic acid(BA)production in Shanghai.BA testing and animal experiments were conducted to confirm the relationship between bon genes and BA biosynthesis,and to clarify the causes of poisoning.Methods:The association between the bon gene cluster and BA synthesis was analyzed through whole-genome sequencing and animal testing to identify the gene cluster responsible for BA synthesis.Results:The overall detection rate of B.gladioli in the 85 samples was 44.7%(38/85).The highest detection rate was in dried black fungus(94.4%;34/36),followed by fresh Tremella fuciformnis(T.fuciformis)(16.6%;2/12),fresh black fungus(9.1%;1/11),and dried T.fuciformis(3.8%;1/26).BGC was detected only in dried black fungus,with a detection rate of 39%(14/36).In the crude extract solutions obtained from the 14 BGC cultures,BA concentrations ranged from 0.33 μg/mL to 714.83 μg/mL.Both the crude extract solution and the ten.-fold concentrated solution caused death in mice.Conclusion:The results of this study demonstrate that all BGC strains carry the bon gene cluster encoding BA,indicating that bonABCDFGHIJKLM plays an essential role in the biosynthesis of BA. 展开更多
关键词 fermented cereal productsin commercially available fungi pathovar cocovenenans bon genes animal experiments Burkholderia gladioli bongkrekic acid ba production foodborne pathogencan
2024年云南省湿米面类食品抽样检测结果分析 认领 引用 被引量:3
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作者 张禹 黄宁 +5 位作者 汤晓召 杨菁 马妮 罗荣爱 陈敏 杨祖顺 《食品安全质量检测学报》 CAS 2026年第5期329-334,共6页
目的评估云南省湿米面制品中蜡样芽孢杆菌、唐菖蒲伯克霍尔德氏菌(Burkholderia gladioli pathovar cocovenenans,BGC)的污染状况及水分和脱氧乙酸的含量。方法2024年7—12月在云南省4州(市)采集散装湿米制品108份(卷粉类48份、米线类4... 目的评估云南省湿米面制品中蜡样芽孢杆菌、唐菖蒲伯克霍尔德氏菌(Burkholderia gladioli pathovar cocovenenans,BGC)的污染状况及水分和脱氧乙酸的含量。方法2024年7—12月在云南省4州(市)采集散装湿米制品108份(卷粉类48份、米线类47份等),覆盖农贸市场(50.93%)、超市(17.59%)、小型餐馆(12.96%)等场所,按GB 4789.14—2014《食品安全国家标准食品微生物学检验蜡样芽胞杆菌检验》和GB 4789.29—2020《食品安全国家标准食品微生物学检验唐菖蒲伯克霍尔德氏菌(椰毒假单胞菌酵米面亚种)检验》检测致病菌,GB 5009.3—2016《食品安全国家标准食品中水分的测定》和GB 5009.121—2016《食品安全国家标准食品中脱氢乙酸的测定》测定水分及脱氢乙酸。结果蜡样芽孢杆菌检出率为31.48%(34/108),定量范围<10~6.8×104CFU/g(P90=4140 CFU/g);卷粉类检出率最高(43.75%,P=0.022),冷藏样品检出率(45.71%)显著高于常温组(P<0.001)。所有样品均未检出BGC及脱氢乙酸超标,有3例湿米面制品水分含量不符合DBS53/017—2023《云南省食品安全地方标准米线、卷粉、饵丝(块)》(≤80 g/100 g)。结论云南湿米制品存在蜡样芽孢杆菌污染风险(尤其卷粉类及冷藏产品),需加强生产流通环节的卫生管控;未发现BGC污染及米酵菌酸中毒隐患。 展开更多
关键词 云南 湿米面类食品 蜡样芽孢杆菌 唐菖蒲伯克霍尔德氏菌 水分 脱氧乙酸
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三重荧光定量聚合酶链反应法检测唐菖蒲伯克霍尔德氏菌及椰毒致病型菌株与洋葱伯克霍尔德氏菌 认领 引用
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作者 蔡锦昂 李丹琪 +3 位作者 陈梓红 徐瑾涛 黄培霖 吴环 《食品安全质量检测学报》 CAS 2025年第24期130-139,共10页
目的建立可同时快速鉴别唐菖蒲伯克霍尔德氏菌及椰毒致病型菌株及洋葱伯克霍尔德氏菌的三重荧光定量聚合酶链式反应(triple fluorescent quantitative polymerase chain reaction,Triple-qPCR)方法。方法针对唐菖蒲伯克霍尔德氏菌的16S-... 目的建立可同时快速鉴别唐菖蒲伯克霍尔德氏菌及椰毒致病型菌株及洋葱伯克霍尔德氏菌的三重荧光定量聚合酶链式反应(triple fluorescent quantitative polymerase chain reaction,Triple-qPCR)方法。方法针对唐菖蒲伯克霍尔德氏菌的16S-23S rRNA基因、其椰毒致病型的产毒基因bonM及洋葱伯克霍尔德氏菌的secY基因设计特异性引物与探针,构建Triple-qPCR检测体系;以16株唐菖蒲伯克霍尔德氏菌(含8株产毒株、8株非产毒株)、8株洋葱伯克霍尔德氏菌及6株近缘/环境干扰菌为试验菌株,优化体系反应条件(退火温度、引物浓度),并验证体系的特异性、灵敏度、重复性及抗干扰能力。结果优化后体系的最佳退火温度为59℃,引物终浓度为0.40μmol/L,探针终浓度为0.20μmol/L;特异性试验中,3个靶基因对目标菌的阴阳性符合率均达100%,无交叉反应;靶基因16S-23S rRNA与bonM的最低检出限(limit of detection,LOD)为1.4×102 CFU/mL,secY基因的LOD为1.6×102 CFU/mL;标准曲线相关系数r2>0.990,扩增效率介于100.9%~106.3%;重复性试验中,组内变异系数(coefficient of variation,CV)0.05);抗干扰试验显示,复杂菌群混合体系中目标菌仍可被特异性检出。结论建立的Triple-qPCR体系具有快速、特异、灵敏、稳定的优势,可实现3种目标的同步鉴别,适用于食品安全领域中唐菖蒲伯克霍尔德氏菌及椰毒致病型菌株与洋葱伯克霍尔德氏菌的高效筛查。 展开更多
关键词 唐菖蒲伯克霍尔德菌椰毒致病型 洋葱伯克霍尔德氏菌 三重荧光定量聚合酶链式反应法
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十字花科黑腐病菌的tRNA基因是适应性表达而不是组成型表达 认领 引用
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作者 龚智宇 胡姗姗 +4 位作者 黎宗洋 苏贝宁 杨玉环 杨卓奇 唐东阶 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2025年第6期578-591,共14页
传统观点认为,一个基因组中所有转运RNA(transfer RNA,tRNA)基因的表达都是恒定且高水平的,而且不同tRNA基因的表达水平都是相似的,属于组成型表达。而今,随着挑战这个观点的实验证据不断涌现,人们越来越意识到tRNA基因的表达可能是适... 传统观点认为,一个基因组中所有转运RNA(transfer RNA,tRNA)基因的表达都是恒定且高水平的,而且不同tRNA基因的表达水平都是相似的,属于组成型表达。而今,随着挑战这个观点的实验证据不断涌现,人们越来越意识到tRNA基因的表达可能是适应性表达而不是组成型表达。本研究采用Northern杂交方法,对十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pathovar campestris,Xcc)8004菌株(Xcc8004菌株)基因组中所有55个注释的tRNA基因在对数生长期的表达水平进行了检测和比较。结果发现,不同tRNA基因的表达水平存在巨大差异:有些高表达、有些中表达、有些低表达、有些则几乎不表达。此外,本研究还发现,tRNA基因XC4365的表达受到果糖的强烈抑制。启动子β-葡萄糖苷酸酶(β-glucuronidase,GUS)报告系统构建和GUS活性检测结果证明,果糖对XC4365表达的抑制作用在XC4365启动子上。这些结果充分证明,在Xcc8004菌株中,tRNA基因的表达是适应性表达而不是组成型表达。 展开更多
关键词 十字花科黑腐病菌 转运RNA(tRNA)基因 表达 果糖
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北京地区核桃黑斑病病原菌的分离、致病性测定和16S rDNA序列分析 认领 引用 被引量:48
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作者 陈善义 陶万强 +2 位作者 王合 李金钟 周涛 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期469-473,I0001,共5页
核桃黑斑病是危害核桃生产的重要细菌病害,造成树势衰弱,减产严重,甚至树体死亡。2008年在北京郊区栽植的幼树上发现疑似病害,且呈爆发之势。为确定其病原菌分类地位,用组织分离法分离核桃黑斑病菌,纯化培养后用针刺接种法回接到健康核... 核桃黑斑病是危害核桃生产的重要细菌病害,造成树势衰弱,减产严重,甚至树体死亡。2008年在北京郊区栽植的幼树上发现疑似病害,且呈爆发之势。为确定其病原菌分类地位,用组织分离法分离核桃黑斑病菌,纯化培养后用针刺接种法回接到健康核桃树枝条和叶片上,14 d后叶片和枝条分别出现典型病斑,接种发病组织再分离所得病菌性状、16S rDNA与初分离的一致,完成柯赫氏法则验证;以分离的核桃黑斑病菌总DNA为模板,采用细菌16SrDNA的通用引物,通过PCR扩增到约1.5 kb的片段,克隆到pMD-18T载体。测序结果表明克隆的16S rDNA片段长为1 453个核苷酸,通过GenBank上BLAST分析,表明该病原细菌为Xanthomonas campestris。 展开更多
关键词 核桃黑腐病 细菌 致病变种
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落葵上发现短小杆菌属(Curtobacterium)一个新的致病变种 认领 引用 被引量:8
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作者 陈永芳 郭坚华 方中达 《植物病理学报》 CAS 北大核心 2000年第2期171-175,共5页
1994年在江苏省南京及镇江地区新发现了落葵细菌性叶斑病 ,从病斑所分离的 10个细菌菌株经柯赫氏法则验证 ,均确系该病的病原菌。采用形态观察、表型特征和生理生化特性测定、数值分析、血清学反应、细胞化学成分分析和 DNA G+C mol%测... 1994年在江苏省南京及镇江地区新发现了落葵细菌性叶斑病 ,从病斑所分离的 10个细菌菌株经柯赫氏法则验证 ,均确系该病的病原菌。采用形态观察、表型特征和生理生化特性测定、数值分析、血清学反应、细胞化学成分分析和 DNA G+C mol%测定进行了鉴定 ,并与植物病原棒形细菌 15个标准菌株进行了比较。该病原菌为革兰氏阳性细菌 ,不规则短杆状 ,有一根鞭毛 ,亚极生或侧生 ,结合其生理生化特性、细胞化学成分和 DNA G+C mol%测定结果 ,认为应属于短小杆菌属( Curtobacterium)的萎蔫短小杆菌 ( Cur.flaccumfaciens) ,数值分析也支持这一结论。此外 ,据血清学反应结果及其对短小杆菌属的其它植物寄主的致病情况 ,认为该病原菌应是萎蔫短小杆菌种下一个新的致病变种 ,定名为 Curtobacterium flaccumfaciens pv.basellae pv.nov.(萎蔫短小杆菌落葵致病变种 )。 展开更多
关键词 落葵 细菌性叶斑病 鉴定 萎蔫短小杆菌 致病变种
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十字花科黑腐病菌中一个与抗逆有关的小RNA的鉴定 认领 引用 被引量:2
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作者 张建玲 赖洁玲 +1 位作者 何媛平 唐东阶 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期614-620,共7页
十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pathovar campestris,Xcc),是引起十字花科植物黑腐病的病原菌。Xcc要经历寄生、腐生等多种环境变化,为适应这些环境变化,需要调控相应基因的表达。除蛋白外,小RNA在基因表达调控中也起到关键... 十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pathovar campestris,Xcc),是引起十字花科植物黑腐病的病原菌。Xcc要经历寄生、腐生等多种环境变化,为适应这些环境变化,需要调控相应基因的表达。除蛋白外,小RNA在基因表达调控中也起到关键作用。本实验室前期实验从Xcc 8004中鉴定出数百个小RNA,但是绝大多数小RNA的功能仍然未知。本研究通过构建一个小RNA(sRNA3843)的过量表达株来研究其生物学功能。确定该小RNA过量表达后,对其过量表达株OE3843进行了一系列的表型检测。结果发现,s RNA3843过量表达株OE3843对金属离子Cu^2+、Zn^2+、Cd^2+及蛋白变性剂SDS的耐受能力明显下降,表明s RNA3843与Xcc的抗逆有关。本研究的实验结果为深入研究小RNA在Xcc抗逆中所起的作用及其作用机理打下基础。 展开更多
关键词 十字花科黑腐病菌 小RNA 过量表达 抗逆作用
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丁香假单胞菌中六个致病变种的全细胞蛋白质电泳分析 认领 引用 被引量:2
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作者 黄琼 任欣正 《云南农业大学学报》 1996年第4期197-202,共6页
利用聚丙稀酰胺电泳技术首次对丁香假单胞菌中6个致病变种全细胞蛋白电泳,发现同一致病变种内菌株蛋白条带一致,不同致病变种之间存在差异。以往对丁香假单胞菌中致病变种的鉴定方法主要是根据致病性的差异,结合营养筛选和血清学方... 利用聚丙稀酰胺电泳技术首次对丁香假单胞菌中6个致病变种全细胞蛋白电泳,发现同一致病变种内菌株蛋白条带一致,不同致病变种之间存在差异。以往对丁香假单胞菌中致病变种的鉴定方法主要是根据致病性的差异,结合营养筛选和血清学方法来进行。对丁香假单胞菌的6个致病变种的全细胞蛋白分析表明:全细胞蛋白质电泳能成功地鉴定到致病变种。 展开更多
关键词 丁香假单胞菌 致病变种 蛋白质
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水稻细菌性条斑病菌的相关研究 认领 引用 被引量:2
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作者 温志杰 《大众科技》 2013年第7期130-131,134,共2页
水稻细菌性条斑病菌(Xanthomonas oryzae pathovar oryzicola,简称Xoc),它是使水稻致病的主要病原菌之一,其引发的水稻细菌性条斑病目前还没有有效的方法控制。文章主要介绍了水稻细菌性条斑病的病原菌、致病机理、研究方法以及防治措施。
关键词 水稻细菌性条斑病 病原菌 致病机理 防治措施
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十字花科黑腐病菌中存在tRNA衍生片段(tRF)的证据 认领 引用
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作者 刘金阳 黄小英 +1 位作者 陈妍妙 唐东阶 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期264-269,共6页
tRNA衍生片段(tRNA-derived fragment, tRF)是一种由内切核糖核酸酶将初级tRNA (primary tRNA)或成熟tRNA分子剪切后形成的长度为14~30 nt (核苷酸)的稳定的RNA片段。研究表明,tRF广泛存在于各种真核生物中,它们既可以作为信号分子,又... tRNA衍生片段(tRNA-derived fragment, tRF)是一种由内切核糖核酸酶将初级tRNA (primary tRNA)或成熟tRNA分子剪切后形成的长度为14~30 nt (核苷酸)的稳定的RNA片段。研究表明,tRF广泛存在于各种真核生物中,它们既可以作为信号分子,又可以作为基因表达的调控因子,在细胞的各种生理过程中发挥重要的调控作用。但至今除了在大肠杆菌(Escherichia coli)和沃氏富盐菌(Haloferax volcanii)中发现了tRF外,在其他原核生物中未见有关tRF的报道。本研究采用高灵敏度的Northern杂交技术对十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv. campestris, Xcc)的苏氨酸-tRNA (threonine-tRNA, tRNAThr)和甲硫氨-tRNA (methionine-tRNA, tRNAMet)进行了检测。结果显示,除了检测到全长的成熟tRNAThr和tRNAMet外,还检测到多个丰度各异的稳定的tRF,而且一些tRF的产生受营养胁迫的诱导。此外,我们还发现,编码tRNAMet的基因XC4381已经退化为非编码RNA基因。本研究证明了tRF在Xcc中的存在,为深入研究tRF的功能,特别是在Xcc致病中的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 十字花科黑腐病菌 tRNA衍生片段 高灵敏度Northern杂交 tRNA基因退化
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十字花科黑腐病菌pilY基因与涌动有关 认领 引用
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作者 李晓霞 唐东阶 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期1017-1024,共8页
细胞的运动在细菌的趋化、粘附、生物膜形成以及致病等过程中发挥关键作用。细菌的运动方式主要有三种:游动(Swimming motility)、涌动(Swarming motility)和颤动(Twitching motility)。游动和涌动由鞭毛介导,而颤动由Ⅳ型纤毛介导。全... 细胞的运动在细菌的趋化、粘附、生物膜形成以及致病等过程中发挥关键作用。细菌的运动方式主要有三种:游动(Swimming motility)、涌动(Swarming motility)和颤动(Twitching motility)。游动和涌动由鞭毛介导,而颤动由Ⅳ型纤毛介导。全基因组测序结果显示,十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv.campestris,Xcc)存在一套完整的合成Ⅳ型纤毛的基因,而且能够产生Ⅳ型纤毛;但有证据表明Xcc不能进行颤动。在实验室之前的研究中发现,Ⅳ型纤毛基因pilH和pilG与Xcc的游动和涌动有关。在本研究中,通过缺失突变体和互补菌的构建,以及表型分析策略,对Ⅳ型纤毛基因pilY进行了生物学功能鉴定。结果发现,pilY缺失突变体的涌动能力比野生型菌株显著增强,而互补菌株的涌动能力与野生型的相似,证明pilY基因具有抑制Xcc涌动的功能。此外,本研究还发现pilY缺失不影响Xcc的生长繁殖、致病力以及致病因子的产生。 展开更多
关键词 十字花科黑腐病菌 Ⅳ型纤毛 pilY 涌动
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The overlapping continuum of host range among strains in the Pseudomonas syringae complex 认领 引用 被引量:1
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作者 Cindy E.Morris Jay Ram Lamichhane +2 位作者 Ivan Nikolić Slaviša Stanković Benoit Moury 《Phytopathology Research》 SCIE 2019年第1期337-352,共16页
Pseudomonas syringae is the most frequently emerging group of plant pathogenic bacteria.Because this bacterium is ubiquitous as an epiphyte and on various substrates in non-agricultural settings,there are many questio... Pseudomonas syringae is the most frequently emerging group of plant pathogenic bacteria.Because this bacterium is ubiquitous as an epiphyte and on various substrates in non-agricultural settings,there are many questions about how to assess the risk for plant disease posed by strains in the environment.Although P.syringae is considered to have discrete host ranges in defined pathovars,there have been few reports of comprehensive comparisons of host range potential.Here we present results of host range tests for 134 strains,representing eight phylogroups,from epidemics and environmental reservoirs on 15 to 22 plant species per test conducted in four separate tests to determine the patterns and extent of host range.We sought to identify trends that are indicative of distinct pathotypes and to assess if strains in the P.syringae complex are indeed restricted in their host range.We show that for each test,strains display a diversity of host ranges from very restricted to very broad regardless of the gamut of phylogroups used in the test.Overall,strains form an overlapping continuum of host range potential with equal representation of narrow,moderate and broad host ranges.Groups of distinct pathotypes,including strains with currently the same pathovar name,could not be identified.The absence of groupings was validated with statistical tests for pattern recognition.The extent of host range was positively correlated with the capacity of strains to swarm on semi-solid agar medium and with the abundance of genes in biosynthetic clusters and was inversely correlated with the abundance of genes for proteins with transmembrane domains in their genomes.Our results are consistent with the current paradigm that disease symptoms are the result of multiple molecular interactions between P.syringae and its plant host that are modulated by abiotic and biotic conditions.This leads us to propose that pathovar denominations do not correspond to the underlying biology of P.syringae.A new concept of pathogenicity that accounts for the continuum of pathogenic potential in P.syringae would open new perspectives to understand the evolution of pathogenicity in this bacterium and new insights to anticipate disease and to manage plant health. 展开更多
关键词 Emergence Network analysis Pathovar Artificial inoculation Swarming motility
Genetic diversity of Harpins from Xanthomonas oryzae and their activity to induce hypersensitive response and disease resistance in tobacco 认领 引用 被引量:14
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作者 LI Ping, LU Xuzhong, SHAO Min, LONG Juying & WANG Jinsheng Department of Plant Pathology, Nanjing Agricultural University Key Laboratory of Monitoring and Management of Plant Disease and Pests, Ministry of Agriculture, Nanjing 210095, China 《Science China(Life Sciences)》 CAS 2004年第5期461-469,共9页
Three hrfA (hypersensitive response-functioning faction A) homologues (hrf1, hrf2 and hrf3) are cloned from 12 strains of Xanthomonas oryzae using PCR based techniques. Hrf1, hrf2 and hrf3 are derived from strains bel... Three hrfA (hypersensitive response-functioning faction A) homologues (hrf1, hrf2 and hrf3) are cloned from 12 strains of Xanthomonas oryzae using PCR based techniques. Hrf1, hrf2 and hrf3 are derived from strains belonging to X. o. pv. oryzae, X. o. pv. oryzicola and X. o. pv. oryzae respectively. Sequence analysis shows that all three genes encode glycine-rich pro-teins with various numbers of GGG-GG motifs. They all share a conserved cysteine residue at position 45 or 47. Hrf1 and hrf3 encode HarpinXoo while hrf2 encodes Harpinxooc. Hrf1 and hrf3 encodes two different types of HarpinXoo proteins. Hrf1 from X. o. pv. oryzae strains ( JxoIII, JxoIV, Jxov, Pxo61, Pxo76, Pxo79, Pxo99, Pxo99 and Pxo124) encodes a 15.6 kD HarpinXoo with 3 GGG-GG motifs while Hrf3 from strain Pxo86 and Pxo112 encodes a 15.9 kD Harpinxoo with 4 GGG-GG motifs. Harpinxooc encoded by hrf2 from X. o. pv. oryzicola (strain RS105) has the mo-lecular weight of 15.3 kD and contains 2 GGG-GG motifs. Cluster analysis is performed using deduced sequences of hrf1, hrf2 and hrf3 as well as previously reported Hpa1 and XopI protein sequence. The results indicated that Harpinxoo and Harpinxooc belong to two closely related sub-groups. Hrf, hrf2 and hrf3 are expressed in E. coli strain BL21 successfully. Under the same condition, hrf1, hrf2 and hrf3 are expressed at the level of 0.389, 0.530 and 0.083 mg/mL re-spectively. All expressed hrf1, hrf2 and hrf3 proteins (Harpins) are shown to be able to induce hypersensitive reaction and TMV resistance on tobacco. Among the three proteins, Hrf2 has the highest activity while Hrf3 has the lowest activity. 展开更多
关键词 pathovars of Xanthomonas oryzae harpins hrfA hpa1 hypersensitive reaction induced resistance
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